Prof.Dr. Sevim IŞIK

MDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik (İngilizce)

sevim.isikuskudar.edu.tr

(0216) 400 2222 / 2462

ORCID: 0000-0001-7687-6082

Documents : 21 | Citation : 576 | h-index : 11

Citation : 1162 | h-index : 17 | i10-index : 19

Araştırma Alanları

Nörodejeneratif ve Nörogelişimsel Hastalıklar, Kök Hücre uygulamaları, Doku mühendisliği, hedefe Yönelik İlaç Taşıma

Araştırma Alanları İle Örtüşen BM Sürdürülebilir Kalkınma Hedef Etiketleri

3 4

Kısa Özgeçmiş

1995 yılında Boğaziçi Üniversitesi Moleculer Biology &Genetics Bölümü’nde tamamlamıştır. Daha sonra Cellular and Molecular Biology İnstitute, Molecular Biology Department Programı’nda 2003 yılında tamamlayarak Doktor unvanını almıştır.

Devamı

Öğrenim Durumu & Akademik Unvanlar

1995

Lisans

Boğaziçi Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik

2003

Doktora

Okayama Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Japonya Medical Science (Denklik: Moleküler Biyoloji ve Genetik)

Doçentlik

Fatih Üniversitesi Biyoloji

2013

Yönetilen Lisansüstü Tezleri

  1. The Investigation of the Anti-inflammatory Effect of Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cell-Derived Exosomes Enriched With Quercetin on a Neuroinflammation Model Using LPS-Induced Microglia HMC3 Cell Line, 2024.
  2. Investigation of the Efficacy of Red Onion-Derived Exosomes on LPS-Induced Neuroinflammation in Human Microglia HMC3 Cell Line, 2024.
  3. Investigation of the Neuroprotective Effects of Resveratrol-Enriched Cord-Derived Mesenchymal Stem Cell Exosomes on Rotenone-Induced In Vitro Parkinson's Disease Model, 2024.
  4. DNA Topoizomeraz IIβ’nın Nöroinflamasyondaki Rolünün Parkinson Hastalığı A53T α-Sinüklein Mutant Transgenik Fare Modelinde Araştırılması, 2024.
  5. Nöral Farklılaştırılmış ve Amiloid β1-42 peptitleriyle in vitro Alzheimer Hastalığı Modeli Oluşturulmuş SHSY5Y hücrelerinde Kararlı DNA Topoisomerase IIb Aşırı İfadesinin Nöroprotektif Rolü, 2024.
  6. İN VİVO SIÇANLARDA OLUŞTURULAN TRAVMA SONRASI STRES BOZUKLUĞU MODELİNDE ARALIKLI ORUÇ UYGULAMASININ TERAPOTİK ETKİSİ, HİPOKAMPAL BÖLGEDE YETİŞKİN NÖROGENEZ DÜZEYİNE ETKİSİ VE İLGİLİ MOLEKÜLER AKTÖRLERİN ARAŞTIRILMASI, 2024.
  7. DNA topoizomeraz IIß'nin Parkinson hastalığı ve nöroinflamasyon belirteçleri ile ilişkili gen ekspresyon seviyeleri üzerindeki rolünün in vitro LPS ve IFNɣ kaynaklı nöroinflamasyon modelinde araştırılması, 2024.
  8. Ferrosen Modifiye Çok Katmanlı Karbon Nanotüplerin Nöroblastoma ve Glioblastoma Hücre Hatları Üzerinde In vitro Anti-Kanser Etkisinin Araştırılması, 2023.
  9. In vitro ko-kültrü sisteminde, mikroglia hücrelerinde DNA topoizomeraz IIß aşırı ifadesinin nöronal hücre canlılığı üzerindeki etkisinin araştırılması, 2023.
  10. LPS İndüklü HMC3 Mikroglia Nöroinflamasyon Modelinde TopoIIß Ekspresyonunun İncelenmesi, 2022.
  11. DNA TOPOİZOMERAZ IIΒ’NIN LPS İLE İNDÜKLENMİŞ HMC3 HÜCRELERİNDE NÖROİNFLAMASYONA ETKİSİ, 2022.
  12. Erken ve Geç Başlangıçlı Alzheimer Vakalarında Erken tanıya Yönelik Genetik Alzheimer Yatkınlık Paneli Hazırlanması, 2022.
  13. Regulation of RhoGTPase dependent axonogenesis by topoisomerase IIβ in cerebellar granular neurons, 2016.
  14. Real time analysis of in vitro photodynamic therapy (PDT) application in MCF-7 human breast cancer line with indocyanine green (ICG) embedded mesoporous magnetic silicon nanoparticle (MSN) molecule, 2016.
  15. The association of parkinson's disease with dna topoisomerase IIβ in neural-differentiated SH-SY5Y cell line, 2015.
  16. Role of DNA Topoisomerase IIβ in Rho GTPase dependent axon growth through neural differentiation of human mesenchmal stem cells, 2015.
  17. Development of novel nanomaterials for non-viral gene delivery, 2015.
  18. Preperation, characterization, and in vitro evaluation of chitosan/nano-zeolite porous scaffolds enriched with human mesenchymal stem cells for bone tissue enginering, 2014.
  19. Association of alzheimer disease with DNA topoisomerase IIß in primary neuronal cells, 2013.
  20. Osteogenic properties of bone marrow derived mesenchymal stem cells on novel nano-hydroxyapatite/chitosan composite scaffolds, 2013.
  21. Investigation of chondrogenic properties of bone marrow derived mesenchymal stem cells on pamam dendrimer incorporated chitosan scaffolds, 2013.
  22. Bioinformatics analysis and gene expression profile of one of the topoisomerase enzymes in Tettrahymena thermophila, 2012.
  23. Effects of the olive extracts on cancer cell lines, 2011.
  24. Neural differentiation potentiall variability of bone marrow derived human mesenchymal stem cells, 2011.
  25. Possible involvement of apoptosis during neural transdifferentiation of bone marrow derived human mesenchymal stem cells by N3 cytokine combination, 2011.
  26. Photodynamic inactivation of different cancer cell lines by protoporphyrin IX and its dopamine conjugate, 2010.
  27. Analysis of DNA topoisomerase IIß dependent gene expression profile of neurally transdifferentiated human mesenchymal stem cells, 2010.
  28. Selective silencing of DNA topoisomerase IIß by siRNA transfection during neural transdifferentiation of hMSCs, 2009.
  29. Cell surface localization and expression of cell surface receptor integrin alpha5/beta1 during proliferation and neural differentiation of human bone marrow mesenchymal stem cells (hMSCs), 2009.
  30. Effect of DNA topoisomerase IIß on transdifferentiation of mesenchymal stem cells into neural cells, 2008.

Akademik Faaliyetler > Yayınlar

(Scopus) Toplam: 29

Competitive Inhibition and Synergistic Effects of Nutraceutical and Metabolite Molecules on Anti-Acetylcholinesterase Activity

Journal of the Turkish Chemical Society Section A: Chemistry (2024)

Identification of the Candidate mGlu2 Allosteric Modulator THRX-195518 through In Silico Method and Evaluation of Its Neuroprotective Potential against Glutamate-Induced Neurotoxicity in SH-SY5Y Cell Line

Current Issues in Molecular Biology (2024)

Enhancing CAR-T cells: unleashing lasting impact potential with phytohemagglutinin activation in in vivo leukemia model

Cancer Gene Therapy (2023)

Novel fluorescein isothiocyanate (FITC) cored PAMAM dendrimers as drug delivery agent

International Journal of Polymeric Materials and Polymeric Biomaterials (2023)

Neuroprotective effects of Cubebin and Hinokinin lignan fractions of Piper cubeba fruit in Alzheimer’s disease in vitro model

Turkish Journal of Biochemistry (2023)

Proposing novel natural compounds against Alzheimer’s disease targeting acetylcholinesterase

PLOS ONE (2023)

Microglia Mediated Neuroinflammation in Parkinson’s Disease

Cells (2023)

Polyamidoamine Dendron-Bearing Lipids as Drug-Delivery Excipients

Molecules (2022)

Folic acid conjugated PAMAM-modified mesoporous silica-coated superparamagnetic iron oxide nanoparticles for potential cancer therapy

Journal of Colloid and Interface Science (2022)

Knockdown of c-MYC Controls the Proliferation of Oral Squamous Cell Carcinoma Cells in vitro via Dynamic Regulation of Key Apoptotic Marker Genes

International Journal of Molecular and Cellular Medicine (2021)

Down regulation of DNA topoisomerase IIβ exerts neurodegeneration like effect through Rho GTPases in cellular model of Parkinson’s disease by Down regulating tyrosine hydroxylase

Neurological Research (2021)

DNA topoisomerase II beta stimulates neurite outgrowth in neural differentiated human mesenchymal stem cells through regulation of Rho-GTPases (RhoA/Rock2 pathway) and Nurr1 expression

STEM CELL RESEARCH & THERAPY (2018)

Cellular model of Alzheimer’s disease: Aβ1-42 peptide induces amyloid deposition and a decrease in topo isomerase IIβ and nurr1 expression

CURRENT ALZHEIMER RESEARCH (2017)

Preparation and characterization of novel chitosan/zeolite scaffolds for bone tissue engineering applications

INTERNATIONAL JOURNAL OF POLYMERIC MATERIALS AND POLYMERIC BIOMATERIALS (2017)

Preparation and characterization of amine functional nano-hydroxyapatite/chitosan bionanocomposite for bone tissue engineering applications

Carbohydrate Polymers (2017)

Boronic Acid vs. Folic Acid: A Comparison of the bio-recognition performances by Impedimetric Cytosensors based on Ferrocene cored dendrimer

Biosensors and Bioelectronics (2017)

Highly Sensitive Detection of Cancer Cells with an Electrochemical Cytosensor Based on Boronic acid Functional Polythiophene

Biosensors and Bioelectronics (2016)

Preparation and in vitro evaluation of 5-flourouracil loaded magnetite-zeolite nanocomposite (5-FU-MZNC) for cancer drug delivery applications

Biomedicine and Pharmacotherapy (2016)

DNA topoisomerase IIβ as a molecular switch in neural differentiation of mesenchymal stem cells

Annals of Hematology (2015)

Influence of gold nanoparticle architecture on in vitro bioimaging and cellular uptake

Journal of Nanoparticle Research (2014)

Delivery of lipophilic porphyrin by liposome vehicles: Preparation and photodynamic therapy activity against cancer cell lines

Photodiagnosis and Photodynamic Therapy (2014)

Ferrocene incorporated PAMAM dendrons: Synthesis, characterization, and anti-cancer activity against AGS cell line

Medicinal Chemistry Research (2013)

Donor age and long-term culture affect differentiation and proliferation of human bone marrow mesenchymal stem cells

Annals of Hematology (2012)

Proliferative and apoptotic effects of olive extracts on cell lines and healthy human cells

Food Chemistry (2012)

Photodynamic activities of protoporphyrin IX and its dopamine conjugate against cancer and bacterial cell viability

Medicinal Chemistry Research (2011)

Comparison of long-term retinoic acid-based neural induction methods of bone marrow human mesenchymal stem cells

In vitro Cellular and developmental Biology-Animal (2011)

Steady and disturbed flow effects on human umbilical vein endothelial cells (HUVECs) in vascular system: an experimental study

ACTA OF BIOENGINEERING AND BIOMECHANICS (2010)

The SUMO pathway is required for selective degradation of DNA topoisomerase IIβ induced by a catalytic inhibitor ICRF‐1931

FEBS Letters (2003)

High incidence of antinuclear antibodies that recognize the matrix attachment region

biochemical and biophysical research communications (2001)

Akademik Faaliyetler > Yayınlar

(Diğer Bilimsel Yayınlar) Toplam: 3

Unraveling Epilepsy: Investigating stem cell approaches for innovative treatment and future cure

Euchembioj Reviews (2024)

Phytohemagglutinin-Activated CAR-T Cells: Prolonged Persistence and Enhanced Anti-Tumor Response in CD19-Specific Acute Lymphoblastic Leukemia

BiorXiv (2023)

Selective silencing of DNA topoisomerase IIβ in human mesenchymal stem cells by siRNAs (small interfering RNAs)

Cell biology international reports (2011)

Akademik Faaliyetler > Kitap - Kitap Bölümü

(Diğer) Toplam: 1
  1. Temel Moleküler Biyoloji: Bölüm 3 (RNA’nın Çok Yönlülüğü) Bölüm 12 (Gen Regülasyonunun Epigenetik Mekanizmaları), Sevim IŞik, Lizabeth A. Allison, PALME, 2014

Akademik Faaliyetler > Editörlük

  1. Biofactors, ISBN:1872-8081, 2021.

Projeler > Projeler

  1. Deneysel Parkinson hastalığı modelinde homeopatik Gelsemium sempervirens’in potansiyel nöroprotektif etkisinin araştırılması: Tedaviye yönelik yeni bir yaklaşım, 2026.
  2. Kırmızı Soğan Kaynaklı Eksozomların, İnsan Mikroglia HMC3 Hücre Hattında LPS İndüklü Nöroinflamasyon Üzerine Etkinliğinin Araştırılması, 2025.
  3. Kuersetin İle Zenginleştirilmiş Kordon Kaynaklı Mezenkimal Kök Hücre Eksozomlarının, LPS İndüklü HMC3 Mikroglia Nöroinflamasyon Modelinde, Antienflamatuar Etkisinin İncelenmesi, 2025.
  4. Mezenkimal Kök Hücre Kaynaklı Eksozomlarının Kronik Obstrüktif Akciğer Hastalığında Progenitor/Kök Hücre Ekspresyonuna ve Hava Yolu Epitel Hücre Senesansı Üzerine Etkilerinin Belirlenmesi, 2027.
  5. İnterferon epsilon (IFN-ε)’nun akciğer kanserinde tümör baskılayıcı özelliklerinin araştırılması ve NK-aracılı immünoterapötik etkilerinin belirlenmesi, 2027.
  6. Farklılaşmamış ve nöronal farklılaştırılmış SH-SY5Y hücrelerinde α-tokoferol ve α-tokoferil fosfatın Topo IIβ ve VEGF ekpresyonu üzerindeki etkilerinin araştırılması, 2025.
  7. Glikojen Depo Hastalığı (GSD) Tip 1a Hastalığının Tedavisi İçin 3B Yazıcı ile Kapsüle Edilmiş G6PC Transgenik Mezenkimal Kök Hücre ve Hepatosit Hücrelerinin Etkinliğinin In Vitro ve Ex Vivo Araştırılması, 2024.
  8. Topoizomeraz IIbeta Aşırı İfade Eden İnsan Kordon Mezenkimal Kök Hücre Kaynaklı Eksozomların 5XFAD Transgenik Alzheimer Hastalığı Fare Modelinde Tedavi Etkinliğinin Araştırılması, 2026.
  9. Genotypical Analysis Project on personalized treatment for psychosis and for dependence on alcohol and other psychotropic substances., 2025.
  10. Nöral Farklılaştırılmış ve Amiloid β1-42 Peptitleriyle in vitro Alzheimer Hastalığı Modeli Oluşturulmuş SHSY5Y Hücrelerinde Kararlı DNA Topoisomerase IIb Aşırı İfadesinin Nöroprotektif Rolünün Araştırılması, 2024.
  11. Nöral Farklılaştırılmış ve Amiloid β1-42 Peptitleriyle in vitro Alzheimer Hastalığı Modeli Oluşturulmuş SHSY5Y Hücrelerinde Kararlı DNA Topoisomerase IIb Aşırı İfadesinin Nöroprotektif Rolünün Araştırılması, 2024.
  12. Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi, 2023.
  13. IL-21 gen ifadelesi arttırılmış NK-92 hücre hattı kaynaklı eksozomların NK hücre aktivasyonu ve tümör öldürme kapasitelerinin araştırılması., 2023.
  14. Doğal Öldürücü Hücre Aktivasyon Gen İfadeleri Arttırılmış Nk-92 Hücre Hattı Kaynaklı Eksozomların, Küçük Hücreli Olmayan Akciğer Karsinom Hastaları Primer Tümör Hücreleri Ve Primer Nk Hücreleri Üzerindeki Etkisinin Araştırılması, 2025.
  15. Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi, 2025.
  16. IL-21 gen ifadelesi arttırılmış NK-92 hücre hattı kaynaklı eksozomların NK hücre aktivasyonu ve tümör öldürme kapasitelerinin araştırılması., 2023.
  17. Valproik Asit ve Kuersetin Yüklü Kitosan Nanopartikülünün Hazırlanması, Karakterizasyonu ve İn Vitro Uygulamaları, 2023.
  18. Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması, 2023.
  19. RhoA/ROCK2 Yolunun Engellenmesiyle, Topo IIβ Enziminin Mikroglialardaki Enflamatuar Modüla-tör Etkisi Ve Nöronlarda Otofajinin İndüklenerek Alfa Sinüklein Agregatlarını Temizleme Etkisinin Araştırılması, 2024.
  20. Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması, 2023.
  21. İn Silico Analiz ile Aday mglu2 Pozitif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi, 2023.
  22. In Silico Analiz ile Aday mglu2 Positif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi, 2023.
  23. Yeşil Sentez Yolu ile Nasturtium officinale (L.) Kullanılarak Elde Edilen Altın Nanopartiküllerin Karakterizasyonu, Biyolojik Aktivitesi ve Antikanser Etkisi, 2023.
  24. DNA topoizomeraz Iıß?nın LPS indüklü mikroglia aracılı Nöroinflamasyonu düzenleyerek nöronal sağkalım üzerindeki etkisinin araştırılması, 2023.
  25. Antibiyotik Dirençli Mycobacterium Smegmatis Bakterisi için CRISPR Kullanarak Dirençsiz Hale Getirmek, 2021.
  26. Antibiyotiğe Dirençli Escherichia Coli Bakterisini CRISPR ile Dirençsiz Hale Getirme, 2021.
  27. Nörogenetik Hastalık Vakalarında Tanıya Yönelik Genetik Yatkınlık Paneli Çalışması, 2022.
  28. Nörogenetik Hastalık Vakalarında Tanıya Yönelik Genetik Yatkınlık Paneli Çalışması, 2022.
  29. Üsküdar Üniversitesi, Hücresel Tedavi ve Kök Hücre Üretim, Uygulama ve Araştırma Merkezi (ÜSKÖKMER) Bünyesinde Kök Hücre ARGE Laboratuvarı ve TRGENMER (Transgenik Hücre Teknolojileri ve Epigenetik Uygulama ve Araştırma Merkezi) Bünyesinde Transgenik Hücre, 2022.
  30. Üsküdar Üniversitesi, Hücresel Tedavi ve Kök Hücre Üretim, Uygulama ve Araştırma Merkezi (ÜSKÖKMER) Bünyesinde Kök Hücre ARGE Laboratuvarı ve TRGENMER (Transgenik Hücre Teknolojileri ve Epigenetik Uygulama ve Araştırma Merkezi) Bünyesinde Transgenik Hücre, 2021.
  31. 2020-BT-01 BİREYSEL VE DÖNÜŞÜMSEL TIP ALANINDA UYGULAMALI İŞ BİRLİĞİ PROJESİ, 2022.
  32. DNA Topoizomeraz IIβ’nın Nöroinflamasyondaki Rolünün Parkinson Hastalığı A53T α-Sinüklein Mutant Transgenik Fare Modelinde Araştırılması ve İlgili Moleküler Yolakların İn Vitro Aydınlatılması, 2023.

Akademik Faaliyetler > Kongre - Konferans Katılım

  1. VIII. Uluslararası Bilimler Işığında Yaratılış Kongresi, 2024.
  2. Gueat Lecture-Alzheimer's Disease, 2024.
  3. Neurodegenerative Disease summit, 2024.
  4. 12. Drug Chemistry Conference, 2024.
  5. 12.Uluslararası İlaç Kimyası kongresi, 2024.
  6. Basic Clinical and Multimodal Imaging (BaCI) 2023 Conference, 2023.
  7. Bilim Farkındalık ve Nadirin Yaşamı Zirvesi, 2023.
  8. 3. MBG Günleri Kongresi, 2023.
  9. CHRISPR CIRCLE, 2023.
  10. Basic Clinical and Multimodal Imaging (BaCI) 2023 Conference, 2023.
  11. 11th International Drug Chemistry Congress, 2023.
  12. 7th International Congress of Molecular Medicine, 2019.

İdari Faaliyetler

  1. Komisyon Üyesi / Member of Commission, Etkinlik Komisyonu, (2024 - Devam ediyor.)
  2. Kurul Üyeliği / Board Member, Merkez Yönetim Kurul Üyeliği, (2023 - Devam ediyor.)
  3. Kurul Üyeliği / Board Member, Uygulama ve Araştırma Merkezi, (2023 - Devam ediyor.)
  4. Kurul Üyeliği / Board Member, Fakülte Kurulu Üyeliği, (2021 - Devam ediyor.)
  5. Kurul Üyeliği / Board Member, Diğer Fakültelerde Kurul Üyeliği, (2021 - Devam ediyor.)
  6. Komisyon Üyesi / Member of Commission, BAP Fakülte Temsilciliği Komisyonu, (2021 - Devam ediyor.)
  7. Öğrenci Kulübü Danışmanlığı / Head of Student Club, IEE Ü.Ü. ÖĞRENCİ KOLU KULÜBÜ, (2021 - Devam ediyor.)
  8. Bölüm Başkan Yardımcısı / Deputy Head of Department, Moleküler Biyoloji ve Genetik (İngilizce) Bölüm Başkan Yardımcısı, (2020 - 2023)
  9. Komisyon Üyesi / Member of Commission, Fakülte Dijital Eğitim Komisyonu, (2020 - Devam ediyor.)
  10. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership, Nörogörüntüleme Çalışma Grubu, (2020 - Devam ediyor.)
  11. Kurul Üyeliği / Board Member, ARGEYEP Yürütme Kurulu Üyeliği, (2019 - Devam ediyor.)
  12. Öğrenci Danışmanlığı / Student Adviser, 41-50 Öğrenci Danışmanlığı, (2019 - Devam ediyor.)
  13. Komisyon Üyesi / Member of Commission, Bologna Komisyonu, (2019 - Devam ediyor.)
  14. Komisyon Üyesi / Member of Commission, Staj Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2019 - 2021)
  15. Komisyon Üyesi / Member of Commission, Eğitim Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2019 - Devam ediyor.)
  16. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership, NPNörogenetik Çalışma Grubu, (2019 - Devam ediyor.)

Eğitim ve Öğretim Faaliyetleri