Bilgisayarlı ilaç tasarımı, Protein mühendisliği, Protein-protein etkileşimleri, Protein-ilaç etkileşimleri, Polimer Bilimi ve Teknolojileri.
nigar.carsibasi
uskudar.edu.tr
(0216) 400 2222 / 2463
ORCID: https://orcid.org/0000-0003-1013-6668
Citation : 1479 | h-index : 7 | i10-index : 6
Araştırma Alanları
Araştırma Alanları İle Örtüşen BM Sürdürülebilir Kalkınma Hedef Etiketleri
Kısa Özgeçmiş
Dr. Öğr. Üyesi Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI ; 1979 İstanbul doğumlu olan Dr. Nigar Kantarcı Çarşıbaşı lise eğitimini 1994-1997 yılları arasında Eyüboğlu Fen Lisesinde tamamlamış ve birincilikle mezun olmuştur. Lisans eğitimini Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümünde 2001 yılında tamamlamıştır. 2001-2003 yılları arasında yüksek lisansını yine Boğaziçi Kimya Mühendisliği’nde devam etmiş ve bu sırada kendi tasarladığı ve kurulumunu gerçekleştirdiği “Kabarcıklı kolon reaktörü” ile ilgili hidrodinamik ve ısı transferi incelemelerinde bulunmuştur. Dr. Kantarcı Çarşıbaşı’nın yaptığı yüksek lisans tez çalışmalarından 2 adet SCI’de yayımlanmış makalesi bulunmaktadır. 2003-2009 yılları arasında Boğaziçi Kimya Mühendisliği Polimer Araştırmaları Merkezi’nde doktora çalışmalarını yürütmüş olan Dr. Kantarcı Çarşıbaşı, doktora çalışmaları kapsamında moleküler dinamik simülasyonu ile metallere bağlanan kısa protein zincirleri üzerine çalışmıştır. Bir başka çalışmasında önemli bir tümör baskılayıcı protein olan p53 proteini ve bu proteinin DNA ile etkileşimi üzerine modelleme çalışmaları yürütmüştür. Doktora tezi kapsamında ise kendi geliştirdiği bir matematiksel modelleme tekniği kullanarak proteinlerin konformasyonel geçişlerini modellemiş, Anizotropik Ağ Modelini Monte Carlo Tekniği ile birleştirerek, birçok protein için açıktan kapalıya, serbestten bağlı forma geçiş yolizi araştırmalarında bulunmuştur. Dr. Nigar Kantarcı Çarşıbaşı’nın doktora çalışmaları kapsamında SCI’da yayımlanmış 4 adet makalesi bulunmaktadır. Halen, Üsküdar Üniversitesi Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Kimya-Biyoloji Mühendisliği Bölümü'nde çalışmalarına devam etmektedir. Çok İyi derecede İngilizce, başlangıç seviyesinde Almanca bilen Dr. Kantarcı Çarşıbaşı’nın akademik ilgi alanları: bioinformatik, protein modellemesi, protein-protein etkileşimleri, protein-yapı-fonksiyon ilişkisi, bilgisayar destekli ilaç tasarımı konularıdır.
Öğrenim Durumu & Akademik Unvanlar
2001
Lisans
Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği
2003
Yüksek Lisans
Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği
2009
Doktora
Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği
Yönetilen Lisansüstü Tezleri
- Nutrasötik moleküllerin pankreas kanserindeki etkinliklerinin in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması, 2024.
- Investigation of the effect of temperature and electrolytic properties on heat transfer and conductivity in aqueous salt solutions, 2024.
- Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması, 2023.
- Kanser tedavisinde Murine Double Minute 2 proteininin inhibasyonu için ligand-bazlı farmakofor modelleme tekniği ile yeni moleküllerin tasarımı, 2022.
Akademik Faaliyetler > Yayınlar
(Scopus) Toplam: 12Advances in Technology Innovation (2024)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Journal of the Turkish Chemical Society Section A: Chemistry (2024)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Current Issues in Molecular Biology (2024)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Queuine as a potential multi-target drug for alzheimer’s disease: insights from protein dynamics
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics (2023)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Proposing novel natural compounds against Alzheimer’s disease targeting acetylcholinesterase
PLOS ONE (2023)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Journal of Computational Biophysics and Chemistry (2021)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Biophysical Journal (2014)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Biophysical Journal (2008)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Cooperative fluctuations point to the dimerization interface of P53 core domain
Biophysical Journal (2006)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
The Canadian Journal of Chemical Engineering (2005)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Akademik Faaliyetler > Yayınlar
(Diğer Bilimsel Yayınlar) Toplam: 2Akademik Faaliyetler > Kitap - Kitap Bölümü
(Diğer) Toplam: 2- Natural Source Drug Molecules Targeting Alzheimer’s Disease, Nigar Kantarcı Çarşıbaşı, Platanus Publishing, 2023
- COMPUTER AIDED DRUG DESIGN: LINKING SIMULATION WITH MEDICINE, Nİgar ÇarŞibaŞi, Efe Akademik Publishing, 2022
Projeler > Projeler
- Insiliko yöntemler ile hedefe yönelik ilaç keşfi, tasarımı ve optimizasyonu, 2027.
- Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları, 2024.
- Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları, 2024.
- Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları, 2024.
- Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi, 2025.
- Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi, 2025.
- Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması, 2023.
- Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması, 2023.
- İn Silico Analiz ile Aday mglu2 Pozitif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi, 2023.
- In Silico Analiz ile Aday mglu2 Positif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi, 2023.
Akademik Faaliyetler > Kongre - Konferans Katılım
- DEU FBE 3rd INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GRADUATE RESEARCH-2024, 2024.
- 5th International Eurasian Conference on Science, Engineering and Technology (EurasianSciEnTech 2024), 2024.
- 5th International Eurasian Conference on Science, Engineering and Technology (EurasianSciEnTech 2024), 2024.
- 12.Uluslararası İlaç Kimyası kongresi, 2024.
- 7th International Conference on Innovative Studies of Contemporary Sciences, 2023.
- 11th International Drug Chemistry Congress, 2023.
- The Sixth International Symposium on Pharmaceutical and Biomedical Sciences (ISPBS-6), 2022.
- 2. Computer-Aided Drug Design Symposium and Workshop-Linking Design, Biology, Chemistry and Medicine, 2022.
- 4th International Conference on Biological and Chemical Sciences, 2021.
- 23th International Conference on Drug Discovery, Design, Development and Optimization, 2021.
- 8th multidisciplinary cancer research congress, 2021.
İdari Faaliyetler
- Ana Bilim Başkanı / Head of Department, Biyoinformatik, (2024 - Devam ediyor.)
- Öğrenci Danışmanlığı / Student Adviser, 81-90 Öğrenci Danışmanlığı, (2023 - Devam ediyor.)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Kalite Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2022 - Devam ediyor.)
- Koordinatör / Coordinator, Erasmus Bölüm Koordinatörlüğü, (2022 - 2023)
- Öğrenci Kulübü Danışmanlığı / Head of Student Club, Kimya-Biyoloji Mühendisliği Kulübü, (2022 - Devam ediyor.)
- Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership, Nörogenetik Çalışma Grubu, (2022 - Devam ediyor.)
- Bölüm Başkan Yardımcısı / Deputy Head of Department, Kimya-Biyoloji Mühendisliği (İngilizce) Bölüm Başkan Yardımcısı, (2021 - Devam ediyor.)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Eğitim Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2019 - Devam ediyor.)
Eğitim ve Öğretim Faaliyetleri
- Drug Design, (Yüksek Lisans / 2023-2024 Bahar)
- Graduation Thesis, (Lisans / 2023-2024 Bahar)
- Organic Chemistry, (Lisans / 2023-2024 Bahar)
- General Chemistry II, (Lisans / 2023-2024 Bahar)
- Polymer Processing Principles, Applications and Modeling, (Yüksek Lisans / 2023-2024 Güz)
- Graduation Project, (Lisans / 2023-2024 Güz)
- Polymer Technology, (Lisans / 2023-2024 Güz)
- Chemical Engineering Laboratory II, (Lisans / 2023-2024 Güz)
- Mass and Energy Balances, (Lisans / 2023-2024 Güz)
- Stoichiometry, (Lisans / 2023-2024 Güz)