Doçent Doktor Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI ; 1979 İstanbul doğumlu olan Dr. Nigar Kantarcı Çarşıbaşı lise eğitimini 1994-1997 yılları arasında Eyüboğlu Fen Lisesinde tamamlamış ve birincilikle mezun olmuştur. Lisans eğitimini Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümünde 2001 yılında tamamlamıştır. 2001-2003 yılları arasında yüksek lisansını yine Boğaziçi Kimya Mühendisliği’nde devam etmiş ve bu sırada kendi tasarladığı ve kurulumunu gerçekleştirdiği “Kabarcıklı kolon reaktörü” ile ilgili hidrodinamik ve ısı transferi incelemelerinde bulunmuştur. Dr. Kantarcı Çarşıbaşı’nın yaptığı yüksek lisans tez çalışmalarından 2 adet SCI’de yayımlanmış makalesi bulunmaktadır. 2003-2009 yılları arasında Boğaziçi Kimya Mühendisliği Polimer Araştırmaları Merkezi’nde doktora çalışmalarını yürütmüş olan Dr. Kantarcı Çarşıbaşı, doktora çalışmaları kapsamında moleküler dinamik simülasyonu ile metallere bağlanan kısa protein zincirleri üzerine çalışmıştır. Bir başka çalışmasında önemli bir tümör baskılayıcı protein olan p53 proteini ve bu proteinin DNA ile etkileşimi üzerine modelleme çalışmaları yürütmüştür. Doktora tezi kapsamında ise kendi geliştirdiği bir matematiksel modelleme tekniği kullanarak proteinlerin konformasyonel geçişlerini modellemiş, Anizotropik Ağ Modelini Monte Carlo Tekniği ile birleştirerek, birçok protein için açıktan kapalıya, serbestten bağlı forma geçiş yolizi araştırmalarında bulunmuştur. Dr. Nigar Kantarcı Çarşıbaşı’nın doktora çalışmaları kapsamında SCI’da yayımlanmış 4 adet makalesi bulunmaktadır. Halen, Üsküdar Üniversitesi Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Kimya-Biyoloji Mühendisliği Bölümü'nde çalışmalarına devam etmektedir. Çok İyi derecede İngilizce, başlangıç seviyesinde Almanca bilen Dr. Kantarcı Çarşıbaşı’nın akademik ilgi alanları: bioinformatik, protein modellemesi, protein-protein etkileşimleri, protein-yapı-fonksiyon ilişkisi, bilgisayar destekli ilaç tasarımı konularıdır.
İçerik
Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI
Doç.Dr.
MDBF / Bölüm Başkanı Yardımcısı - Kimya Mühendisliği / FBE Biyoinformatik Yüksek Lisans Anabilim Dalı Başkanı
Bizi Değerlendir
Araştırma Alanları
Bilgisayarlı ilaç tasarımı
Biyoinformatik
Protein mühendisliği
Protein-protein etkileşimleri
Protein-ilaç etkileşimleri
Polimer Bilimi ve Teknolojileri.
Kısa Özgeçmiş
Öğrenim Durumu & Akademik Ünvanlar
Lisans
Boğaziçi Üniversitesi
2001
Yüksek Lisans
Boğaziçi Üniversitesi
2003
Araştırma Görevlisi
Boğaziçi Üniversitesi
2003
Doktora
Boğaziçi Üniversitesi
2009
Dr. Öğretim Üyesi
Üsküdar Üniversitesi
2019
Projeler > Projeler
Toplam: 17
1
Uyutan İplik (Sleeping Yarn)2028
2
Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Sitotoksik Etkinliğinin Araştırılması2026
3
Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Karsinogenez Mekanizmaları Üzerine Etkisinin Araştırılması2026
4
Nutrasötik Quein molekülü için etkinliğini artırmaya yönelik in siliko formülasyon geliştirilmesi ve optimizasyonu.2026
5
Farklı LABSA ve SLES parametrelerine sahip deterjanların kemik dokudan DNA İzolasyonuna etkisinin araştırılması2026
6
Farklı boyutlardaki çinko oksit (ZnO) nanoparçacıklarının güneş koruyucu etkisinin UVA/UVB parametre değerleri ile araştırılması2026
7
Histamin H4 reseptörünün inhibisyonunu sağlayacak doğal kaynaklı potansiyel antihistaminik moleküllerin in siliko keşfi ve in vitro kimyasal validasyonu2026
8
Insiliko yöntemler ile hedefe yönelik ilaç keşfi, tasarımı ve optimizasyonu2027
9
Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları2024
10
Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları2024
11
Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları2024
12
Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi2025
13
Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi2025
14
Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması2023
15
Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması2023
16
İn Silico Analiz ile Aday mglu2 Pozitif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi2023
17
In Silico Analiz ile Aday mglu2 Positif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi2023
Yönetilen Lisansüstü Tezler
Toplam: 4
1
Nutrasötik moleküllerin pankreas kanserindeki etkinliklerinin in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması2024
2
Investigation of the effect of temperature and electrolytic properties on heat transfer and conductivity in aqueous salt solutions2024
3
Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması2023
4
Kanser tedavisinde Murine Double Minute 2 proteininin inhibasyonu için ligand-bazlı farmakofor modelleme tekniği ile yeni moleküllerin tasarımı2022
Akademik Faaliyetler > Kongre - Konferans Katılım
Toplam: 11
1
DRUG REPOSITIONING FOR ALZHEIMER'S DISEASE AND GLIOBLASTOMA TREATMENT2024
2
Investigation of the heat transfer characteristics and electrical conductivities of NaCl, KCl, and NaNO3 solutions2024
3
Discovery and biological evaluation of potential Map4k4 inhibitors for the treatment of pancreatic cancer2024
4
Queuine as a potential multi-target drug for Alzheimer’s Disease2024
5
INVESTIGATION OF NOVEL NATURAL COMPOUNDS AGAINST ALZHEIMER’S DISEASE TARGETING ACETYLCHOLINESTERASE2023
6
Proposing novel natural compounds against Alzheimer’s Disease targeting acetylcholinesterase2023
7
TOWARDS MORE POTENT ANTICANCER DRUGS: PHARMACOPHORE MODEL ACCOMPANIED BY CONFORMATIONAL DYNAMICS REVEALS NEW P53 ACTIVATORS2022
8
Pharmacophore Model Accompanied by Conformational Dynamics Reveals New Anti-cancer Drugs2022
9
Identification of natural molecules for anticancer activity against MDM2 using conformational dynamics and molecular docking2021
10
Elucidation of Dynamics of MDM2 Shed Light on the Anti-cancer Drug Development2021
11
Global Dynamics of MDM2 and Alterations Caused by Inhibitor Binding: an Elastic Network Model Approach2021
İdari Faaliyetler
Toplam: 9
1
Laboratuvar Sorumlusu2025
2
100 -150 Öğrenci Danışmanlığı2025
3
Biyoinformatik2024
4
Kalite Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO)2022
5
Erasmus Bölüm Koordinatörlüğü2022
6
Kimya-Biyoloji Mühendisliği Kulübü2022
7
Nörogenetik Çalışma Grubu2022
8
Kimya-Biyoloji Mühendisliği (İngilizce) Bölüm Başkan Yardımcısı2021
9
Eğitim Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO)2019
Eğitim ve Öğretim Faaliyetleri
Toplam: 9
1
Polymer Processing Principles, Applications and ModelingLISANSUSTU / 2024
2
Graduation ThesisLISANS / 2024
3
General Chemistry IILISANS / 2024
4
Modelleme ve SimülasyonLISANSUSTU / 2024
5
Drug DesignLISANSUSTU / 2024
6
Graduation ProjectLISANS / 2024
7
Mass and Energy BalancesLISANS / 2024
8
General Chemistry ILISANS / 2024
9

