Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI
Dr. Öğr. Üyesi
MDBF / Bölüm Başkanı Yardımcısı - Kimya Mühendisliği / FBE Biyoinformatik Yüksek Lisans Anabilim Dalı Başkanı
Araştırma Alanları
Kısa Özgeçmiş
Dr. Öğr. Üyesi Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI ; 1979 İstanbul doğumlu olan Dr. Nigar Kantarcı Çarşıbaşı lise eğitimini 1994-1997 yılları arasında Eyüboğlu Fen Lisesinde tamamlamış ve birincilikle mezun olmuştur. Lisans eğitimini Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümünde 2001 yılında tamamlamıştır. 2001-2003 yılları arasında yüksek lisansını yine Boğaziçi Kimya Mühendisliği’nde devam etmiş ve bu sırada kendi tasarladığı ve kurulumunu gerçekleştirdiği “Kabarcıklı kolon reaktörü” ile ilgili hidrodinamik ve ısı transferi incelemelerinde bulunmuştur. Dr. Kantarcı Çarşıbaşı’nın yaptığı yüksek lisans tez çalışmalarından 2 adet SCI’de yayımlanmış makalesi bulunmaktadır. 2003-2009 yılları arasında Boğaziçi Kimya Mühendisliği Polimer Araştırmaları Merkezi’nde doktora çalışmalarını yürütmüş olan Dr. Kantarcı Çarşıbaşı, doktora çalışmaları kapsamında moleküler dinamik simülasyonu ile metallere bağlanan kısa protein zincirleri üzerine çalışmıştır. Bir başka çalışmasında önemli bir tümör baskılayıcı protein olan p53 proteini ve bu proteinin DNA ile etkileşimi üzerine modelleme çalışmaları yürütmüştür. Doktora tezi kapsamında ise kendi geliştirdiği bir matematiksel modelleme tekniği kullanarak proteinlerin konformasyonel geçişlerini modellemiş, Anizotropik Ağ Modelini Monte Carlo Tekniği ile birleştirerek, birçok protein için açıktan kapalıya, serbestten bağlı forma geçiş yolizi araştırmalarında bulunmuştur. Dr. Nigar Kantarcı Çarşıbaşı’nın doktora çalışmaları kapsamında SCI’da yayımlanmış 4 adet makalesi bulunmaktadır. Halen, Üsküdar Üniversitesi Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Kimya-Biyoloji Mühendisliği Bölümü'nde çalışmalarına devam etmektedir. Çok İyi derecede İngilizce, başlangıç seviyesinde Almanca bilen Dr. Kantarcı Çarşıbaşı’nın akademik ilgi alanları: bioinformatik, protein modellemesi, protein-protein etkileşimleri, protein-yapı-fonksiyon ilişkisi, bilgisayar destekli ilaç tasarımı konularıdır.
Öğrenim Durumu & Akademik Ünvanlar
Lisans
Boğaziçi Üniversitesi
2001
Yüksek Lisans
Boğaziçi Üniversitesi
2003
Araştırma Görevlisi
Boğaziçi Üniversitesi
2003
Doktora
Boğaziçi Üniversitesi
2009
Dr. Öğretim Üyesi
Üsküdar Üniversitesi
2019
Projeler > Projeler
Toplam: 16
Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Sitotoksik Etkinliğinin Araştırılması2026
Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Karsinogenez Mekanizmaları Üzerine Etkisinin Araştırılması2026
Nutrasötik Quein molekülü için etkinliğini artırmaya yönelik in siliko formülasyon geliştirilmesi ve optimizasyonu.2026
Farklı LABSA ve SLES parametrelerine sahip deterjanların kemik dokudan DNA İzolasyonuna etkisinin araştırılması2026
Farklı boyutlardaki çinko oksit (ZnO) nanoparçacıklarının güneş koruyucu etkisinin UVA/UVB parametre değerleri ile araştırılması2026
Histamin H4 reseptörünün inhibisyonunu sağlayacak doğal kaynaklı potansiyel antihistaminik moleküllerin in siliko keşfi ve in vitro kimyasal validasyonu2026
Insiliko yöntemler ile hedefe yönelik ilaç keşfi, tasarımı ve optimizasyonu2027
Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları2024
Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları2024
Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları2024
Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi2025
Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi2025
Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması2023
Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması2023
İn Silico Analiz ile Aday mglu2 Pozitif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi2023
In Silico Analiz ile Aday mglu2 Positif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi2023
Yönetilen Lisansüstü Tezler
Toplam: 4
Nutrasötik moleküllerin pankreas kanserindeki etkinliklerinin in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması2024
Investigation of the effect of temperature and electrolytic properties on heat transfer and conductivity in aqueous salt solutions2024
Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması2023
Kanser tedavisinde Murine Double Minute 2 proteininin inhibasyonu için ligand-bazlı farmakofor modelleme tekniği ile yeni moleküllerin tasarımı2022
Akademik Faaliyetler > Kongre - Konferans Katılım
Toplam: 11
DRUG REPOSITIONING FOR ALZHEIMER'S DISEASE AND GLIOBLASTOMA TREATMENT2024
Investigation of the heat transfer characteristics and electrical conductivities of NaCl, KCl, and NaNO3 solutions2024
Discovery and biological evaluation of potential Map4k4 inhibitors for the treatment of pancreatic cancer2024
Queuine as a potential multi-target drug for Alzheimer’s Disease2024
INVESTIGATION OF NOVEL NATURAL COMPOUNDS AGAINST ALZHEIMER’S DISEASE TARGETING ACETYLCHOLINESTERASE2023
Proposing novel natural compounds against Alzheimer’s Disease targeting acetylcholinesterase2023
TOWARDS MORE POTENT ANTICANCER DRUGS: PHARMACOPHORE MODEL ACCOMPANIED BY CONFORMATIONAL DYNAMICS REVEALS NEW P53 ACTIVATORS2022
Pharmacophore Model Accompanied by Conformational Dynamics Reveals New Anti-cancer Drugs2022
Identification of natural molecules for anticancer activity against MDM2 using conformational dynamics and molecular docking2021
Elucidation of Dynamics of MDM2 Shed Light on the Anti-cancer Drug Development2021
Global Dynamics of MDM2 and Alterations Caused by Inhibitor Binding: an Elastic Network Model Approach2021
İdari Faaliyetler
Toplam: 9
Laboratuvar Sorumlusu2025
100 -150 Öğrenci Danışmanlığı2025
Biyoinformatik2024
Kalite Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO)2022
Erasmus Bölüm Koordinatörlüğü2022
Kimya-Biyoloji Mühendisliği Kulübü2022
Nörogenetik Çalışma Grubu2022
Kimya-Biyoloji Mühendisliği (İngilizce) Bölüm Başkan Yardımcısı2021
Eğitim Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO)2019
Eğitim ve Öğretim Faaliyetleri
Toplam: 9

