Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI

Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI

ORCID0000-0003-1013-6668

Dr. Öğr. Üyesi

MDBF / Bölüm Başkanı Yardımcısı - Kimya Mühendisliği / FBE Biyoinformatik Yüksek Lisans Anabilim Dalı Başkanı

BM Hedef 3BM Hedef 4BM Hedef 9BM Hedef 12BM Hedef 17
Bizi Değerlendir

Akademik Bağlantılar

Scopus
Documents:14
Citations:1114
h-index:7
Google Scholar
Citations:1577
h-index:7
i10-index:7

39

Web of ScienceResearchgateYÖKPublons

Araştırma Alanları

Bilgisayarlı ilaç tasarımı
Protein mühendisliği
Protein-protein etkileşimleri
Protein-ilaç etkileşimleri
Polimer Bilimi ve Teknolojileri.

Kısa Özgeçmiş

Dr. Öğr. Üyesi Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI ; 1979 İstanbul doğumlu olan Dr. Nigar Kantarcı Çarşıbaşı lise eğitimini 1994-1997 yılları arasında Eyüboğlu Fen Lisesinde tamamlamış ve birincilikle mezun olmuştur. Lisans eğitimini Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümünde 2001 yılında tamamlamıştır. 2001-2003 yılları arasında yüksek lisansını yine Boğaziçi Kimya Mühendisliği’nde devam etmiş ve bu sırada kendi tasarladığı ve kurulumunu gerçekleştirdiği “Kabarcıklı kolon reaktörü” ile ilgili hidrodinamik ve ısı transferi incelemelerinde bulunmuştur. Dr. Kantarcı Çarşıbaşı’nın yaptığı yüksek lisans tez çalışmalarından 2 adet SCI’de yayımlanmış makalesi bulunmaktadır. 2003-2009 yılları arasında Boğaziçi Kimya Mühendisliği Polimer Araştırmaları Merkezi’nde doktora çalışmalarını yürütmüş olan Dr. Kantarcı Çarşıbaşı, doktora çalışmaları kapsamında moleküler dinamik simülasyonu ile metallere bağlanan kısa protein zincirleri üzerine çalışmıştır. Bir başka çalışmasında önemli bir tümör baskılayıcı protein olan p53 proteini ve bu proteinin DNA ile etkileşimi üzerine modelleme çalışmaları yürütmüştür. Doktora tezi kapsamında ise kendi geliştirdiği bir matematiksel modelleme tekniği kullanarak proteinlerin konformasyonel geçişlerini modellemiş, Anizotropik Ağ Modelini Monte Carlo Tekniği ile birleştirerek, birçok protein için açıktan kapalıya, serbestten bağlı forma geçiş yolizi araştırmalarında bulunmuştur. Dr. Nigar Kantarcı Çarşıbaşı’nın doktora çalışmaları kapsamında SCI’da yayımlanmış 4 adet makalesi bulunmaktadır. Halen, Üsküdar Üniversitesi Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Kimya-Biyoloji Mühendisliği Bölümü'nde çalışmalarına devam etmektedir. Çok İyi derecede İngilizce, başlangıç seviyesinde Almanca bilen Dr. Kantarcı Çarşıbaşı’nın akademik ilgi alanları: bioinformatik, protein modellemesi, protein-protein etkileşimleri, protein-yapı-fonksiyon ilişkisi, bilgisayar destekli ilaç tasarımı konularıdır.

Öğrenim Durumu & Akademik Ünvanlar

Lisans

Boğaziçi Üniversitesi

2001

Yüksek Lisans

Boğaziçi Üniversitesi

2003

Araştırma Görevlisi

Boğaziçi Üniversitesi

2003

Doktora

Boğaziçi Üniversitesi

2009

Dr. Öğretim Üyesi

Üsküdar Üniversitesi

2019

Projeler > Projeler

Toplam: 16

1

Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Sitotoksik Etkinliğinin Araştırılması
2026

2

Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Karsinogenez Mekanizmaları Üzerine Etkisinin Araştırılması
2026

3

Nutrasötik Quein molekülü için etkinliğini artırmaya yönelik in siliko formülasyon geliştirilmesi ve optimizasyonu.
2026

4

Farklı LABSA ve SLES parametrelerine sahip deterjanların kemik dokudan DNA İzolasyonuna etkisinin araştırılması
2026

5

Farklı boyutlardaki çinko oksit (ZnO) nanoparçacıklarının güneş koruyucu etkisinin UVA/UVB parametre değerleri ile araştırılması
2026

6

Histamin H4 reseptörünün inhibisyonunu sağlayacak doğal kaynaklı potansiyel antihistaminik moleküllerin in siliko keşfi ve in vitro kimyasal validasyonu
2026

7

Insiliko yöntemler ile hedefe yönelik ilaç keşfi, tasarımı ve optimizasyonu
2027

8

Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları
2024

9

Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları
2024

10

Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları
2024

11

Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi
2025

12

Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi
2025

13

Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması
2023

14

Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması
2023

15

İn Silico Analiz ile Aday mglu2 Pozitif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi
2023

16

In Silico Analiz ile Aday mglu2 Positif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi
2023

Yönetilen Lisansüstü Tezler

Toplam: 4

1

Nutrasötik moleküllerin pankreas kanserindeki etkinliklerinin in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması
2024

2

Investigation of the effect of temperature and electrolytic properties on heat transfer and conductivity in aqueous salt solutions
2024

3

Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması
2023

4

Kanser tedavisinde Murine Double Minute 2 proteininin inhibasyonu için ligand-bazlı farmakofor modelleme tekniği ile yeni moleküllerin tasarımı
2022

Akademik Faaliyetler > Kongre - Konferans Katılım

Toplam: 11

1

DRUG REPOSITIONING FOR ALZHEIMER'S DISEASE AND GLIOBLASTOMA TREATMENT
2024

2

Investigation of the heat transfer characteristics and electrical conductivities of NaCl, KCl, and NaNO3 solutions
2024

3

Discovery and biological evaluation of potential Map4k4 inhibitors for the treatment of pancreatic cancer
2024

4

Queuine as a potential multi-target drug for Alzheimer’s Disease
2024

5

INVESTIGATION OF NOVEL NATURAL COMPOUNDS AGAINST ALZHEIMER’S DISEASE TARGETING ACETYLCHOLINESTERASE
2023

6

Proposing novel natural compounds against Alzheimer’s Disease targeting acetylcholinesterase
2023

7

TOWARDS MORE POTENT ANTICANCER DRUGS: PHARMACOPHORE MODEL ACCOMPANIED BY CONFORMATIONAL DYNAMICS REVEALS NEW P53 ACTIVATORS
2022

8

Pharmacophore Model Accompanied by Conformational Dynamics Reveals New Anti-cancer Drugs
2022

9

Identification of natural molecules for anticancer activity against MDM2 using conformational dynamics and molecular docking
2021

10

Elucidation of Dynamics of MDM2 Shed Light on the Anti-cancer Drug Development
2021

11

Global Dynamics of MDM2 and Alterations Caused by Inhibitor Binding: an Elastic Network Model Approach
2021

İdari Faaliyetler

Toplam: 9

1

Laboratuvar Sorumlusu
2025

2

100 -150 Öğrenci Danışmanlığı
2025

3

Biyoinformatik
2024

4

Kalite Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO)
2022

5

Erasmus Bölüm Koordinatörlüğü
2022

6

Kimya-Biyoloji Mühendisliği Kulübü
2022

7

Nörogenetik Çalışma Grubu
2022

8

Kimya-Biyoloji Mühendisliği (İngilizce) Bölüm Başkan Yardımcısı
2021

9

Eğitim Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO)
2019

Eğitim ve Öğretim Faaliyetleri

Toplam: 9

1

Polymer Processing Principles, Applications and Modeling
LISANSUSTU / 2024

2

Graduation Thesis
LISANS / 2024

3

General Chemistry II
LISANS / 2024

4

Modelleme ve Simülasyon
LISANSUSTU / 2024

5

Drug Design
LISANSUSTU / 2024

6

Graduation Project
LISANS / 2024

7

Mass and Energy Balances
LISANS / 2024

8

General Chemistry I
LISANS / 2024

9

Stoichiometry
LISANS / 2024