Antibiyotik Direnci, Endüstriyel Biyoteknoloji, Omik Teknolojiler, Metabolizma Mühendisliği, Protein Mühendisliği
fatmagizem.avci
uskudar.edu.tr
(0216) 400 2222 / 0
ORCID: 0000-0001-6618-0487
Documents : 18 | Citation : 269 | h-index : 9
Citation : 447 | h-index : 12 | i10-index : 13
Araştırma Alanları
Araştırma Alanları İle Örtüşen BM Sürdürülebilir Kalkınma Hedef Etiketleri
Kısa Özgeçmiş
Lisans eğitimini 2010 yılında Ege Üniversitesi Biyomühendislik Bölümü’nde tamamladı. Yüksek lisans derecesini 2013 yılında Ege Üniversitesi Biyomühendislik Anabilim Dalı’nda aldı. Yüksek lisans çalışmaları sırasında ERASMUS değişim programı ile Belçika’da bulunan Gent Üniversitesi, Biyoteknoloji Bölümü’ne gitmeye hak kazandı ve metabolizma mühendisliği ile ilgili çalışmalara katıldı. 2013’te Marmara Üniversitesi Biyomühendislik Anabilim Dalı’nda başladığı doktora eğitimini 2018 yılında tamamladı. Aynı süre içerisinde Marmara Üniversitesi Biyomühendislik Bölümü’nde araştırma görevlisi olarak çalıştı. Doktorası sırasında bitki kökenli çeşitli maddelerin antimikrobiyal etki mekanizmaları ve beta-laktamaz enzimindeki allosterik regülasyonlar üzerine araştırmalar yaptı. Ayrıca kazandığı FEMS Araştırma Bursu ile Lyon, Fransa’da bulunan Ulusal Bilimsel Araştırma Merkezi’nde (CNRS-Centre National de la Recherche Scientifique) bakteriyel membran proteinlerinin karakterizasyonu ile ilgili çalışmalar gerçekleştirdi.
Üsküdar Üniversitesi Biyomühendislik Bölümü'nde çalışmalarına devam eden Fatma Gizem Avcı’nın ilgi alanları arasında antibiyotik direnci, protein mühendisliği, metabolizma mühendisliği, omik teknolojiler ve endüstriyel biyoteknoloji bulunmaktadır.
Öğrenim Durumu & Akademik Unvanlar
2010
Lisans
Ege Üniversitesi Biyomühendislik
2013
Yüksek Lisans
Ege Üniversitesi Biyomühendislik
2018
Doktora
Marmara Üniversitesi Biyomühendislik (İngilizce)
Yönetilen Lisansüstü Tezleri
- Investigation of the Antivirulence Agents Targeting the Type IV Pili, 2023.
Akademik Faaliyetler > Yayınlar
(Scopus) Toplam: 19Antivirulence therapy: type IV pilus as a druggable target for bacterial infections
Medicinal Chemistry Research (2024)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Phycoremediation: a path towards heavy metal bioremediation from wastewater
Journal of Chemical Technology & Biotechnology (2024)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Unraveling bacterial stress responses: implications for next-generation antimicrobial solutions
World Journal of Microbiology and Biotechnology (2024)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Attenuation of Type IV pili activity by natural products
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics (2024)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
A review on the mechanistic details of OXA enzymes of ESKAPE pathogens
Pathogens and Global Health (2022)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Carvacrol Enhances the Antimicrobial Potency of Berberine in Bacillus subtilis
Current Microbiology (2022)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Identification of novel inhibitors of the ABC transporter BmrA
Bioorganic Chemistry (2020)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Microbial Pathogenesis (2020)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Repurposing bioactive aporphine alkaloids as efflux pump inhibitors
Fitoterapia (2019)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
OMICS: A Journal of Integrative Biology (2018)
0
0
0
0
Smart Citations0
0
0
0
Citing PublicationsSupportingMentioningContrasting
See how this article has been cited at scite.ai
scite shows how a scientific paper has been cited by providing the context of the citation, a classification describing whether it supports, mentions, or contrasts the cited claim, and a label indicating in which section the citation was made.
Akademik Faaliyetler > Yayınlar
(Diğer Bilimsel Yayınlar) Toplam: 2Curvularia lunata: A fungus for possible berberine transformation
International Journal of Secondary Metabolite (2022)
Evaluation of silibinin as an efflux pump inhibitor in Bacillus subtilis
International Journal of Secondary Metabolite (2021)
Akademik Faaliyetler > Kitap - Kitap Bölümü
(Diğer) Toplam: 3- Modeling the Microbial Cells for Biotechnological Applications, Fatma Ece Altınışık Kaya, Fatma Gizem Avcı, IGI Global, 2023
- Antibacterial and antifungal activities of isoquinoline alkaloids of the Papaveraceae and Fumariaceae families and their implications in structure–activity relationships, Fatma Gizem Avci, Basak Atas, Gizem Gulsoy Toplan, Caglayan Gurer, Bernasariyar Akbulut, Elsevier, 2021
- Fermente Ürünler Teknolojisi ve Mikrobiyolojisi- Antibiyotik Üretimi, Fatma Gizem Avcı, Nihat Alpagu Sayar, Berna Sarıyar Akbulut, Nobel Akademik Yayıncılık, 2020
Projeler > Projeler
- ESKAPE patojenlerinde yaygın bulunan D-sınıfı beta-laktamazlara karşı ortak inhibitörlerin belirlenmesi, 2026.
- Tip 4 pili protein kompleksinin inhibisyonu ve inhibisyon dinamiğinin karakterizasyonu, 2023.
Akademik Faaliyetler > Kongre - Konferans Katılım
- 13th International CeBiTec Research Conference Bielefeld, 2024.
- 19th European Congress on Biotechnology 2024, 2024.
- 47th FEBS Congress, 2023.
- 8th International BAU Drug Design Congress, 2022.
- 4th Eurasia Biochemical Approaches & Technologies Congress (EBAT), 2022.
- FEMS Conference on Microbiology 2022, 2022.
- 9. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi, 2020.
- MuTaLig COST ACTION CA15135 4th WG meeting, 2020.
İdari Faaliyetler
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Strateji Geliştirme Koordinatörlüğü Komisyonu, (2024 - Devam ediyor.)
- Öğrenci Danışmanlığı / Student Adviser, 41-50 Öğrenci Danışmanlığı, (2023 - 2024)
- Ana Bilim Başkanı / Head of Department, Biyomühendislik, (2022 - 2024)
- Bölüm Başkanlığı / Head of Department, Biyomühendislik (İngilizce), (2022 - 2024)
- Laboratuvar, Laboratuvar Sorumlusu, (2022 - 2024)
- Çalışma Grubu Koordinatörlüğü / Coordinator of Research Group, Biyomühendislik Çalışma Grubu, (2022 - 2024)
- Koordinatör / Coordinator, Erasmus Koordinatörlüğü (Enstitü / Fakülte / MYO), (2022 - 2024)
- Kurul Üyeliği / Board Member, Enstitü Kurulu Üyeliği, (2022 - 2024)
- Kurul Üyeliği / Board Member, Fakülte Kurulu Üyeliği, (2022 - 2024)
- Koordinatör / Coordinator, ARGEYEP Koordinatörlüğü (Enstitü / Fakülte / MYO), (2022 - 2024)
- Öğrenci Danışmanlığı / Student Adviser, 31-40 Öğrenci Danışmanlığı, (2022 - 2023)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Bologna Komisyonu, (2022 - 2024)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Mezuniyet Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2022 - 2024)
- Bölüm Başkan Yardımcısı / Deputy Head of Department, Biyomühendislik (İngilizce) Bölüm Başkan Yardımcısı, (2021 - 2022)
- Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership, Biyomühendislik Çalışma Grubu, (2020 - Devam ediyor.)
- Öğrenci Danışmanlığı / Student Adviser, 41-50 Öğrenci Danışmanlığı, (2019 - 2022)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Staj Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2019 - 2021)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Kalite Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2019 - 2022)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Eğitim Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2019 - 2021)
Eğitim ve Öğretim Faaliyetleri
- Physical Chemistry, (Lisans / 2023-2024 Güz)
- İlaç Biyoteknolojisi, (Yüksek Lisans / 2023-2024 Güz)
- Graduation Project, (Lisans / 2023-2024 Güz)
- Introduction to Biotechnology, (Lisans / 2023-2024 Güz)