Antibiyotik Direnci, Endüstriyel Biyoteknoloji, Omik Teknolojiler, Metabolizma Mühendisliği, Protein Mühendisliği
fatmagizem.avci
uskudar.edu.tr
(0216) 400 2222 2471
ORCID: 0000-0001-6618-0487
Documents : 18 | Citation : 269 | h-index : 9
Citation : 398 | h-index : 10 | i10-index : 11
Araştırma Alanları
Araştırma Alanları İle Örtüşen BM Sürdürülebilir Kalkınma Hedef Etiketleri
Kısa Özgeçmiş
Lisans eğitimini 2010 yılında Ege Üniversitesi Biyomühendislik Bölümü’nde tamamladı. Yüksek lisans derecesini 2013 yılında Ege Üniversitesi Biyomühendislik Anabilim Dalı’nda aldı. Yüksek lisans çalışmaları sırasında ERASMUS değişim programı ile Belçika’da bulunan Gent Üniversitesi, Biyoteknoloji Bölümü’ne gitmeye hak kazandı ve metabolizma mühendisliği ile ilgili çalışmalara katıldı. 2013’te Marmara Üniversitesi Biyomühendislik Anabilim Dalı’nda başladığı doktora eğitimini 2018 yılında tamamladı. Aynı süre içerisinde Marmara Üniversitesi Biyomühendislik Bölümü’nde araştırma görevlisi olarak çalıştı. Doktorası sırasında bitki kökenli çeşitli maddelerin antimikrobiyal etki mekanizmaları ve beta-laktamaz enzimindeki allosterik regülasyonlar üzerine araştırmalar yaptı. Ayrıca kazandığı FEMS Araştırma Bursu ile Lyon, Fransa’da bulunan Ulusal Bilimsel Araştırma Merkezi’nde (CNRS-Centre National de la Recherche Scientifique) bakteriyel membran proteinlerinin karakterizasyonu ile ilgili çalışmalar gerçekleştirdi.
Üsküdar Üniversitesi Biyomühendislik Bölümü'nde çalışmalarına devam eden Fatma Gizem Avcı’nın ilgi alanları arasında antibiyotik direnci, protein mühendisliği, metabolizma mühendisliği, omik teknolojiler ve endüstriyel biyoteknoloji bulunmaktadır.
Öğrenim Durumu & Akademik Unvanlar
Yönetilen Lisansüstü Tezleri
- Investigation of the Antivirulence Agents Targeting the Type IV Pili, 2023.
Akademik Faaliyetler > Yayınlar
(Scopus) Toplam: 16Attenuation of Type IV pili activity by natural products
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics (2024)
A review on the mechanistic details of OXA enzymes of ESKAPE pathogens
Pathogens and Global Health (2022)
Carvacrol Enhances the Antimicrobial Potency of Berberine in Bacillus subtilis
Current Microbiology (2022)
Targeting a hidden site on class A beta-lactamases
Journal of Molecular Graphics and Modelling (2018)
An OMIC approach to elaborate the antibacterial mechanisms of different alkaloids
Phytochemistry (2017)
An evolutionarily conserved allosteric site modulates beta-lactamase activity
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry (2016)
1, 3-propanediol production with Citrobacter werkmanii DSM17579: effect of a dhaD knock-out
Microbial Cell Factories (2014)
The effects of cell recycling on the production of 1, 3-propanediol by Klebsiella pneumoniae
Bioprocess and Biosystems Engineering (2013)
Akademik Faaliyetler > Yayınlar
(Diğer Bilimsel Yayınlar) Toplam: 2Curvularia lunata: A fungus for possible berberine transformation
International Journal of Secondary Metabolite (2022)
Evaluation of silibinin as an efflux pump inhibitor in Bacillus subtilis
International Journal of Secondary Metabolite (2021)
Akademik Faaliyetler > Kitap - Kitap Bölümü
- Modeling the Microbial Cells for Biotechnological Applications, 2023.
- Antibacterial and antifungal activities of isoquinoline alkaloids of the Papaveraceae and Fumariaceae families and their implications in structure–activity relationships, 2021.
- Fermente Ürünler Teknolojisi ve Mikrobiyolojisi- Antibiyotik Üretimi, 2020.
Projeler > Projeler
- ESKAPE patojenlerinde yaygın bulunan D-sınıfı beta-laktamazlara karşı ortak inhibitörlerin belirlenmesi, 2026.
- Tip 4 pili protein kompleksinin inhibisyonu ve inhibisyon dinamiğinin karakterizasyonu, 2023.
Akademik Faaliyetler > Kongre - Konferans Katılım
- 47th FEBS Congress, 2023.
- 8th International BAU Drug Design Congress, 2022.
- 4th Eurasia Biochemical Approaches & Technologies Congress (EBAT), 2022.
- FEMS Conference on Microbiology 2022, 2022.
- 9. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi, 2020.
- MuTaLig COST ACTION CA15135 4th WG meeting, 2020.
İdari Faaliyetler
- Öğrenci Danışmanlığı / Student Adviser, 41-50 Öğrenci Danışmanlığı, (2023 - 2024)
- Ana Bilim Başkanı / Head of Department, Biyomühendislik, (2022 - 2024)
- Bölüm Başkanlığı / Head of Department, Biyomühendislik (İngilizce), (2022 - 2024)
- Laboratuvar, Laboratuvar Sorumlusu, (2022 - 2024)
- Kurul Üyeliği / Board Member, Fakülte Kurulu Üyeliği, (2022 - 2024)
- Çalışma Grubu Koordinatörlüğü / Coordinator of Research Group, Biyomühendislik Çalışma Grubu, (2022 - 2024)
- Koordinatör / Coordinator, ARGEYEP Koordinatörlüğü (Enstitü / Fakülte / MYO), (2022 - 2024)
- Koordinatör / Coordinator, Erasmus Koordinatörlüğü (Enstitü / Fakülte / MYO), (2022 - 2024)
- Kurul Üyeliği / Board Member, Enstitü Kurulu Üyeliği, (2022 - 2024)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Bologna Komisyonu, (2022 - 2024)
- Öğrenci Danışmanlığı / Student Adviser, 31-40 Öğrenci Danışmanlığı, (2022 - 2023)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Mezuniyet Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2022 - 2024)
- Bölüm Başkan Yardımcısı / Deputy Head of Department, Biyomühendislik (İngilizce) Bölüm Başkan Yardımcısı, (2021 - 2022)
- Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership, Biyomühendislik Çalışma Grubu, (2020 - Devam ediyor.)
- Öğrenci Danışmanlığı / Student Adviser, 41-50 Öğrenci Danışmanlığı, (2019 - 2022)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Eğitim Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2019 - 2021)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Staj Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2019 - 2021)
- Komisyon Üyesi / Member of Commission, Kalite Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO), (2019 - 2022)
Eğitim ve Öğretim Faaliyetleri
- Graduation Thesis, (Lisans / 2022-2023 Bahar)
- Bioengineering Laboratory I, (Lisans / 2022-2023 Bahar)
- Biochemistry, (Lisans / 2022-2023 Bahar)
- Introduction to Bioengineering, (Lisans / 2022-2023 Bahar)
- Physical Chemistry, (Lisans / 2022-2023 Güz)
- Protein Yapı ve Fonksiyonu, (Yüksek Lisans / 2022-2023 Güz)
- Graduation Project, (Lisans / 2022-2023 Güz)
- Introduction to Biotechnology, (Lisans / 2022-2023 Güz)