Bioengineering Working Group

Members

Dr.Öğr. Üyesi Fatma Gizem AVCI

FENS / Bioengineering Master Program

Dr.Öğr. Üyesi Tuğba BAL

FENS / Head of the Bioengineering Department (English)

Dr.Öğr. Üyesi Maide Gökçe BEKAROĞLU

Faculty of Engineering and Natural Sciences / Bioengineering (English) - Deputy Head of the Bioengineering Department (English)

Dr.Öğr. Üyesi Handan EMİŞOĞLU KÜLAHLI

FENS / Bioengineering

Dr.Öğr. Üyesi Betül GÜRÜNLÜ

FENS / Bioengineering

Dr.Öğr. Üyesi İmran GÖKER

FENS / Bioengineering

Dr.Öğr. Üyesi Mehdi PARTOVI MERAN

FENS / Bioengineering

Arş.Gör. Yeşim AYIK

FENS / Bioengineering

Arş.Gör. Meryem Kevser ZELKA

FENS / Bioengineering

Projects

  • Tekrarlayan Aftöz Stomatit Tedavisinde Kullanılan Ticari Kimyasal İlaç Etkenlerine Alternatif Olabilecek Bitkisel Bileşiklerin In siliko Belirlenmesi

    Kategori: TÜBİTAK Öğrenci Projesi

    Başvuru Kabul No: 1919B012321057

    Tarih: 03.2024

  • Türkiye’nin Bazı Endemik Bitki Türlerinde Yer Alan ve Uyuz Hastalığının Tedavisinde Kullanılabilecek Olan Aktif Bileşenlerin Moleküler Kenetlenme Yöntemi Aracılığıyla Belirlenmesi

    Kategori: TÜBİTAK Öğrenci Projesi

    Başvuru Kabul No: 1919B012337226

    Tarih: 03.2024

  • ESKAPE patojenlerinde yaygın bulunan D-sınıfı beta-laktamazlara karşı ortak inhibitörlerin belirlenmesi

    Kategori: TÜBİTAK

    Başvuru Kabul No: 123Z538

    Tarih: 11.2023

  • Nanodelik Yapılı Grafen Oksit ile Grafen Oksit Karşılaştırması: C. elegans Modelinde Biyouyumluluk ve Toksisite Analizi

    Kategori: TÜBİTAK Öğrenci Projesi

    Başvuru Kabul No: 1919B012310872

    Tarih: 06.2023

  • 3D Nöron Modelinde Alzheimer Hastalığına Karşı Flavonoid Etkisinin Araştırılması

    Kategori: Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları

    Başvuru Kabul No: 27888

    Tarih: 01.2023

  • Muşmula (Mespilus germanica) ve yerelması (Helianthus tuberosus) bitkilerinin antioksidan aktivitelerinin Rooibos (Aspalathus linearis) bitkisinin antioksidan aktivitesi ile karşılaştırılması

    Kategori: TÜBİTAK Öğrenci Projesi

    Başvuru Kabul No: 1919B012003312

    Tarih: 05.2021

  • BEYAZ ÇAY, BAMYA TOHUMU VE KIRAZ SAPI BITKILERININ ANTIOKSIDAN AKTIVITELERININ BELIRLENMESI

    Kategori: TÜBİTAK Öğrenci Projesi

    Başvuru Kabul No: 1919B011904136

    Tarih: 03.2020

  • SİYAH ÇAY VE KEKİK ÇAYI BİTKİ ÖZÜTLERİNİ KULLANARAK POLİMERİK NANOFİBER SENTEZİ

    Kategori: TÜBİTAK Öğrenci Projesi

    Başvuru Kabul No: 1919B011904321

    Tarih: 03.2020

  • DEMANS ve ALZHEİMER HASTALIKLARINDA MERKEZİ PROTEİN TAYİNİ VE BUNLARIN İLAÇ ETKENLERİ VE BİTKİ AKTİFLERİ İLE KENETLENMESİ

    Kategori: TÜBİTAK Öğrenci Projesi

    Başvuru Kabul No: 1919B011801206

    Tarih: 08.2018

Research Focus

Projects, publications, presentations, and various events related to studies to be carried out in the fields of bioprocesses, genetic engineering, bioinformatics, and Nano-bioengineering are planned for Undergraduate and Master's Degree students of Bioengineering.

Published Papers (Indexed in Scopus Database)
The Books / Book Chapters
Kongre-Konferans Katılımları

  • New inhibitors of the BmrA pump identified through virtual screening

    Kongre-Konferans Adı: MuTaLig COST ACTION CA15135 4th WG meeting

    Tarih: 05.03.2020

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi FATMA GİZEM AVCI

  • BIOINFORMATICS ANALYSIS OF MEMORY RELATED GENES INVESTIGATES ASSOCIATION WITH BIOLOGICAL PATHWAYS AND INTERACTIONS

    Kongre-Konferans Adı: ANKARA INTERNATIONAL CONGRESS ON SCIENTIFIC RESEARCH-III

    Tarih: 03.10.2020

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Tuba SEVİMOĞLU

  • Investigation of the Association of Human Antimicrobial Peptides and Human Intestinal Microbiota Through Bioinformatics Tools

    Kongre-Konferans Adı: 2ND INTERNATIONAL EURASIAN CONFERENCE ON SCIENCE, ENGINEERING AND TECHNOLOGY (EURASIANSCIENTECH 2020)

    Tarih: 08.10.2020

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Tuba SEVİMOĞLU

  • Beta-Laktamazda Dinamik İlişki İndeksi ile Gizli Ceplerin Belirlenmesi

    Kongre-Konferans Adı: 9. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi

    Tarih: 20.12.2020

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi FATMA GİZEM AVCI

  • BIOINFORMATICS ANALYSIS OF DERMATOMYOSITIS, GAUCHER DISEASE AND MELAS SYNDROME

    Kongre-Konferans Adı: 3rd International Congress on Medical Sciences and Innovation

    Tarih: 12.01.2021

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Tuba SEVİMOĞLU

  • Synthesis and Characterization of Electrospun Nanofibers Loaded with Black Tea/Thyme Plant Extracts as an Antimicrobial Wound Dressing

    Kongre-Konferans Adı: Applications Of Chemistry In Nanosciences And Biomaterials Engineering

    Tarih: 25.06.2021

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Tuba SEVİMOĞLU

  • High level of DEK isoform-2 delays recovery from doxorubicin induced DNA damage

    Kongre-Konferans Adı: The 45th FEBS Congress

    Tarih: 03.07.2021

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Zihni Onur ÇALIŞKANER

  • Screening of FDA-Approved Natural Drugs as Anti-Virulence Agents Against Pseudomonas aeruginosa and Neisseria meningitidis

    Kongre-Konferans Adı: FEMS Conference on Microbiology 2022

    Tarih: 30.06.2022

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi FATMA GİZEM AVCI

  • Investigation of the Inhibition of Pseudomonas aeruginosa Type IV Pili Elongation ATPases to Prevent Biofilm Formation

    Kongre-Konferans Adı: 4th Eurasia Biochemical Approaches & Technologies Congress (EBAT)

    Tarih: 03.11.2022

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi FATMA GİZEM AVCI

  • Antioxidant and Antimicrobial Properties of Silver Nanoparticles Synthesized from Sebin Walnut Oil

    Kongre-Konferans Adı: 5th International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2022)

    Tarih: 24.11.2022

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Betül Gürünlü

  • Green synthesis of silver nanoparticles from Tarragon (Artemisia dracunculus) leaves and their antioxidant and antimicrobial activities

    Kongre-Konferans Adı: 5th International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2022)

    Tarih: 24.11.2022

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Betül Gürünlü

  • Paclitaxel-loaded Graphene Nanocarriers with Antidot Nanoholes

    Kongre-Konferans Adı: 8th International Bahçeşehir University (BAU) Drug Design Congress

    Tarih: 15.12.2022

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi MEHDİ MERAN

  • Antioxidant and Antimicrobial Properties of Silver Nanoparticles Synthesized From Sebin Walnut Oil

    Kongre-Konferans Adı: The 15th International Scientific Research Congress - Science and Engineering/15. Uluslararası Bilimsel Araştırmalar Kongresi -Fen ve Mühendislik Bilimleri

    Tarih: 18.12.2022

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Betül Gürünlü

  • Green synthesis of silver nanoparticles from Tarragon (Artemisia dracunculus) leaves and their antioxidant and antimicrobial activities

    Kongre-Konferans Adı: The 15th International Scientific Research Congress - Science and Engineering/15. Uluslararası Bilimsel Araştırmalar Kongresi -Fen ve Mühendislik Bilimleri

    Tarih: 18.12.2022

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Betül Gürünlü

  • Green Synthesis of Silver Nanoparticles from Sebin Walnut Septum Extract and their Antioxidant and Antibacterial Activities

    Kongre-Konferans Adı: The 15th International Scientific Research Congress - Science and Engineering/15. Uluslararası Bilimsel Araştırmalar Kongresi -Fen ve Mühendislik Bilimleri

    Tarih: 18.12.2022

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Betül Gürünlü

  • Sebin Cevizi (Juglans Regia) Ağaç Yapraklarından Gümüş Nanopartiküller: Yeşil Sentezi ve Antioksidan, Antibakteriyel ve Fotokatalitik Aktiviteleri

    Kongre-Konferans Adı: The 15th International Scientific Research Congress - Science and Engineering/15. Uluslararası Bilimsel Araştırmalar Kongresi -Fen ve Mühendislik Bilimleri

    Tarih: 18.12.2022

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Betül Gürünlü

  • Investigation of Antioxidant, Antibacterial, and Photocatalytic Activities of Silver Nanoparticles Synthesized via Sebin Walnut (Juglans Regia L.) Kernel’s Extract

    Kongre-Konferans Adı: Pharma Colloquium 2023 - 4th edition

    Tarih: 24.04.2023

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Betül Gürünlü

  • Investigation of OXA enzyme inhibitors using computational tools

    Kongre-Konferans Adı: 8th International BAU Drug Design Congress

    Tarih: 15.12.2022

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi FATMA GİZEM AVCI

  • A drug repurposing study on the inhibition of type IV pili

    Kongre-Konferans Adı: 47th FEBS Congress

    Tarih: 08.07.2023

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi FATMA GİZEM AVCI

  • MOLECULAR DYNAMICS STUDY ON GRAPHENE-BASED NANOMATERIALS AS SMART NANOCARRIERS FOR RAPAMYCIN ANTICANCER DRUG

    Kongre-Konferans Adı: CUKUROVA 12th INTERNATIONAL SCIENTIFIC RESEARCHES CONFERENCE

    Tarih: 10.03.2024

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi MEHDİ MERAN

  • Nanohole-Decorated Graphene Oxide as A Nanocarrier for Paclitaxel: A Molecular Dynamics Simulations Study

    Kongre-Konferans Adı: 4. ULUSLARARASI BİLİMSEL ARAŞTIRMALAR VE YENİLİKÇİ ÇALIŞMALAR SEMPOZYUMU

    Tarih: 13.03.2024

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi MEHDİ MERAN

  • IDENTIFICATION OF ALTERNATIVE COMPOUNDS OF PLANT ORIGIN FOR WOUND, SCAR AND BURN TREATMENTS IN SILICO

    Kongre-Konferans Adı: 19th International Scientific Research Congress

    Tarih: 17.03.2024

    Katılımcı(lar): Arş. Gör. Yeşim AYIK, Doç. Dr. Vildan ENİSOĞLU ATALAY

  • Computational Identification of New Candidate Actives of Plant Origin for Natural/Anti‐Photo Skin Aging

    Kongre-Konferans Adı: 4th International Symposium of Scientific Research and Innovative Studies

    Tarih: 13.03.2024

    Katılımcı(lar): Doç. Dr. Vildan ENİSOĞLU ATALAY, Arş. Gör. Yeşim AYIK

  • MOLECULAR DYNAMICS STUDY ON GRAPHENE-BASED NANOMATERIALS AS SMART NANOCARRIERS FOR RAPAMYCIN ANTICANCER DRUG

    Kongre-Konferans Adı: 10th INTERNATIONAL BLACK SEA COASTLINE COUNTRIES SCIENTIFIC RESEARCH CONFERENCE

    Tarih: 07.04.2024

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi MEHDİ MERAN

  • Ocimum Basilicum Lamiaceae Bitkisinden İzole Edilen Kuersetinin 2B ve 3B Sistemlerde PC-12 Hücrelerinin Sağkalımı Üzerine Etkisi

    Kongre-Konferans Adı: ISPEC 16TH International Conference on Engineering & Natural Sciences

    Tarih: 01.06.2024

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi TUĞBA BAL, Dr. Öğr. Üyesi Salih TUNCAY, Dr. Öğr. Üyesi Shirin TARBIAT

  • DPD Modeling of Stimuli-Responsive Polymeric Molecular Brushes

    Kongre-Konferans Adı: 16th International Seminar on Polymer Science and Technology (ISPST 2024)

    Tarih: 07.09.2024

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi MEHDİ MERAN

  • DETERMINATION OF CHOLESTEROL IN BIOSENSOR BY DIFFERENTIAL PULSE VOLTAMETRY

    Kongre-Konferans Adı: 6th Engineers of Future International Student Symposium

    Tarih: 10.09.2024

    Katılımcı(lar): Öğr. Gör. Mehmet KAVACIK

  • SARS 1 -COV-2 DETECTION BY A NOVEL QTF-BASED IMMUNOSENSOR

    Kongre-Konferans Adı: 33. International Symposium on Pharmaceutical and Biomedical Analysis

    Tarih: 02.07.2023

    Katılımcı(lar): Öğr. Gör. Mehmet KAVACIK

  • Exploring the Potential of Drug Repurposing Against Abnormally Regulated Cell-Matrix Interactions in the Treatment of Pancreatic Cancer (Computational Study)

    Kongre-Konferans Adı: STRA International Conference on Engineering & Technology

    Tarih: 10.10.2024

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi TUĞBA BAL

  • Catabolism and production of sugar acids by Corynebacterium glutamicum

    Kongre-Konferans Adı: 19th European Congress on Biotechnology 2024

    Tarih: 30.06.2024

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi FATMA GİZEM AVCI

  • Engineering Corynebacterium glutamicum via Retrosynthesis Approach for Glucaric Acid Production from Algal Biomass

    Kongre-Konferans Adı: 13th International CeBiTec Research Conference Bielefeld

    Tarih: 16.09.2024

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi FATMA GİZEM AVCI

Other Scientific Studies

  • ÜÜTv-Üsküdar'a Gelirken Programı

    Kategori: Detaylı Medya Katılımı

    Tarih: 09.07.2024

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi TUĞBA BAL

    Youtube Videosu

  • Spheroid-Based Systems in Pancreatic Tissue Engineering

    Kategori: Fakülte - Bölüm veya SHMYO - Program semineri verme

    Tarih: 13.02.2024

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi TUĞBA BAL

  • 9. Biyomühendislik Günlerinde Moderatörlük

    Kategori: Detaylı Medya Katılımı

    Tarih: 07.05.2021

    Katılımcı(lar): Dr. Öğr. Üyesi Tuba SEVİMOĞLU

    Youtube Videosu

    • Tüm Çalışma Grupları