The Computational Biology and In silico Studies Group uses various bioinformatics tools to identify genes involved in diseases (especially neurodegenerative diseases and cancer) and/or important cellular pathways, to identify gene-gene interactions, to predict polymorphisms that may affect the structure and function of proteins that are the products of genes, and to model proteins structurally.
Computational Biology and In Silico Working Group
Projects
Konjenital Laktoz İntoleransı İle İlişkili LCT Genine Ait Olası Zararlı Missense Tek Nükleotit Polimorfizmlerinin Analiz Edilmesi ve Hastalığa Karşı Yeni İlaç Aday Moleküllerinin In Silico Metotlar İle Geliştirilmesi
Category: TÜBİTAK
Application No: 125Z687
Date: 2025-08-29
Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Sitotoksik Etkinliğinin Araştırılması
Category: BAP projesi
Application No: 5169
Date: 2025-05-27
Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Karsinogenez Mekanizmaları Üzerine Etkisinin Araştırılması
Category: BAP projesi
Application No: 5166
Date: 2025-05-27
Research Focus
Books
- Handbook of Regenerative Medicine Stem Cell-based Approach
Category: Book Citation Index'de taranan yayınevi tarafından basılmış kitap bölümü yazarlığı
ISBN: E-ISBN 9781003464594
Date: 2025-01-01
Authors:Prof. Dr. Muhsin KONUKDr. Öğr. Üyesi Öznur Özge Özcan
- SHMYO için Temel Biyokimya (Lipitler ve Biyomoleküller)
Category: ÜÜ yayinevi tarafından basılmış kitap bölümü yazarlığı
ISBN: 978-605-9596-81-7
Date: 2023-01-01
Authors:Dr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANDr. Öğr. Üyesi Salih TUNCAYDr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAYDr. Öğr. Üyesi Öznur Özge Özcan
PublicationsNumber of Publications Indexed in WOS: 18Number of Other Publications: 9
- Molecular Docking, ADME, toxicity, and flexibility analysis of compounds in Withania somnifera L. for dopamine D2 receptor inhibition
Publication Title: Balıkesir Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
Date: 2025-10-25
- In Silico Analysis of Structural and Functional Impacts of Missense SNPs of SNCA Gene in Parkinson’s Disease
Publication Title: Kafkas Journal of Medical Sciences
DOI: 10.5505/kjms.2025.24307
Date: 2025-10-20
- Discovering Queuine from shape to property: insights from DFT calculations and MD simulations
Publication Title: Molecular Simulation
DOI: 10.1080/08927022.2025.2576150
Date: 2025-10-10
Conference Participations
ALZHEİMER HASTALIĞINDA ROLÜ OLAN BETA SEKRETAZ GENİNİN (BACE1) IN SILICO ANALİZİ
Conference Name: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Date: 2019-10-30
Participants:Prof. Dr. Muhsin KONUKDr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANProf. Dr. Korkut ULUCANDr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
BİLGİSAYAR TABANLI YAZILIM ARAÇLARI İLE APH1B GENİNDEKİ FONKSİYONEL SNP’LERİN TAHMİN EDİLMESİ
Conference Name: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Date: 2018-10-29
Participants:Prof. Dr. Muhsin KONUKDr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANProf. Dr. Korkut ULUCANDr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
In silico analizler ile insan BAK1 genindeki fonksiyonel SNP’lerin tanımlanması
Conference Name: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Date: 2018-05-03
Participants:Dr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
Other Activities
In Slico Laboratuvar kullanımı Eğitim Semineri 2 (SHMYO ve Mühendislik ve Doğa Bilimlerinden katılımcı akademisyen ve yüksek lisans öğrencilerine yönelik Eğitim)
Category: Fakülte - Bölüm veya SHMYO - Program semineri verme
Date: 2025-09-23
Participants: Dr. Öğr. Üyesi NİGAR ÇARŞIBAŞI
In Slico Laboratuvar kullanımı Eğitim Semineri 1 (SHMYO ve Mühendislik ve Doğa Bilimlerinden katılımcı akademisyen ve yüksek lisans öğrencilerine yönelik Eğitim)
Category: Fakülte - Bölüm veya SHMYO - Program semineri verme
Date: 2025-09-16
Participants: Dr. Öğr. Üyesi NİGAR ÇARŞIBAŞI
TEKNOFEST yarışması (P4MEDI ekibi )
Category: Yarışmalara katılan öğrenci projelerinde danışmanlık
Date: 2025-03-20
Participants: Prof. Dr. Muhsin KONUK
Related Enstitü, Fakülte, Meslek Yüksekokulu
Members
- Prof. Muhsin KONUK
Advisor to the President / FENS / Molecular Biology and Genetics (English) / Head of Molecular Biology Master Program
Asst. Prof. Ebru ÖZKAN OKTAYVSHS/ Laboratory Technology - Head of Program
Asst. Prof. Tuğba KAMANVSHS / Health Sciences Institute / Medicinal and Aromatic Plants - Head of Program
Asst. Prof. Ömer Faruk KARASAKALVSHS / Acting Director/ Medical Laboratory Techniques- Head of Program / Radiotherapy/ ÜSUZEM Vice Director
Asst. Prof. Salih TUNCAYVSHS / Food Technology / Scientific Research Projects (BAP/SRP) Coordinator
- RA (Ph.D.) İrem Gülfem AKIN
FENS / Molecular Biology and Genetics (English)

