Hesaplamalı Biyoloji ve In silico Çalışmaları Grubu, çeşitli biyoinformatik araçlar kullanarak hastalıklar (özellikle nörodejeneratif hastalıklar ve kanser) ile ilgili ve/veya önemli hücresel yolaklarda görev alan genlerin belirlenmesi, gen-gen etkileşimlerinin tespiti, genlerin ürünü olan proteinlerin yapısı ve fonksiyonu üzerine etkisi olabilecek polimorfizmlerin tahmin edilmesi ve proteinlerin yapısal olarak modellenmesi konusunda çalışmalar yapmaktadır.
Hesaplamalı Biyoloji ve İn-Silico Çalışma Grubu
İçerik
Araştırma Odağı
Toplantı ÖzetleriSon 5 Toplantı Listelenmektedir
Bi̇yoki̇myasal Hesaplamalar Çalışma Grubu'nun 25092025 tarihli toplantısında “Üsküdar Üniversitesi in silico Araştırmalar Laboratuvarı (ÜSİNSİLİCOLAB)”ın kullanımı ve yürütülebilecek bilgisayar destekli uygulamalar hakkında görüşülmüştür.
Projeleri
Aronia melanocarpa (Siyah Aronya) Meyvesinin Farklı Fraksiyonlarından Elde Edilen Ekstrelerin Antioksidan Kapasitelerinin ve LC-MS/MS ile Fenolik Bileşen Profilinin Belirlenmesi”
Kategori: TÜBİTAK
Başvuru No: 1139B412502985
Tarih: 2026-06-30
Aronia melanocarpa (Siyah Aronya) Meyvesinin Farklı Fraksiyonlarından Elde Edilen Ekstrelerin Antioksidan Kapasitelerinin ve LC-MS/MS ile Fenolik Bileşen Profilinin Belirlenmesi
Kategori: TÜBİTAK Öğrenci Projesi
Başvuru No: 1139B412502985
Tarih: 2026-05-15
Uyutan İplik (Sleeping Yarn)
Kategori: TÜBİTAK
Başvuru No: 5250102
Tarih: 2025-12-12
YayınlarıScopus'ta taranan dergilerdeki yayın sayısı: 39Diğer Yayınların Sayısı: 18
- Short and efficient synthesis of the natural triterpenoids α- and β-amyrins with detailed in silico screening and in vitro anticancer evaluation against breast and prostate cancer cells
Yayın Adı: Computational Biology and Chemistry
DOI: 10.1016/j.compbiolchem.2026.109333
Tarih: 2026-12-01
Yazarlar:Dr. Öğr. Üyesi Salih TUNCAY
- Antioxidant capacity and α-glucosidase inhibitor activity of Bryonia aspera extracts and its major constituent p-coumaric acid: Phytochemical analysis, biological evaluation and computational approach
Yayın Adı: Journal of Molecular Structure
DOI: 10.1016/j.molstruc.2026.146580
Tarih: 2026-10-01
Yazarlar:Dr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Salih TUNCAYÖğr. Gör. Dr. İsra TOPTANCI
- Experimental and molecular dynamics investigation of ZnO nanoparticle size effects on sunscreen performance and skin-lipid interactions
Yayın Adı: Journal of Molecular Modeling
DOI: 10.1007/s00894-026-06954-7
Tarih: 2026-09-07
Yazarlar:Dr. Öğr. Üyesi Shirin TARBIATDoç. Dr. Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI
Kitapları
- Bioactive Peptides Produced From Microbial Sources and Their Neuroprotective Effects: Microbial Peptides
Kategori: Scopus/BKCI'de taranan yayınevi tarafından basılmış kitap yazarlığı
ISBN: ISBN13: 9798337341392, Isbn13Softcover: 9798337341408, EISBN13: 9798337341415
Tarih: 2026-01-01
Yazarlar:Prof. Dr. Muhsin KONUK
- Handbook of Regenerative Medicine Stem Cell-based Approach
Kategori: Scopus/BKCI'de taranan yayınevi tarafından basılmış kitap bölümü yazarlığı
ISBN: E-ISBN 9781003464594
Tarih: 2025-01-01
Yazarlar:Prof. Dr. Muhsin KONUKDoç. Dr. Öznur Özge ÖZCAN
- Role of Stem Cell-Based Therapy in Neurodegenerative, Ocular, and Cardiovascular Diseases
Kategori: Scopus/BKCI'de taranan yayınevi tarafından basılmış kitap bölümü yazarlığı
ISBN: 9781003464594
Tarih: 2025-01-01
Yazarlar:Doç. Dr. Öznur Özge ÖZCAN
Kongre-Konferans Katılımları
ALZHEİMER HASTALIĞINDA ROLÜ OLAN BETA SEKRETAZ GENİNİN (BACE1) IN SILICO ANALİZİ
Kongre Adı: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Tarih: 2019-10-30
Katılımcılar:Prof. Dr. Muhsin KONUKDr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANProf. Dr. Korkut ULUCANDr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
BİLGİSAYAR TABANLI YAZILIM ARAÇLARI İLE APH1B GENİNDEKİ FONKSİYONEL SNP’LERİN TAHMİN EDİLMESİ
Kongre Adı: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Tarih: 2018-10-29
Katılımcılar:Prof. Dr. Muhsin KONUKDr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANProf. Dr. Korkut ULUCANDr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
In silico analizler ile insan BAK1 genindeki fonksiyonel SNP’lerin tanımlanması
Kongre Adı: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Tarih: 2018-05-03
Katılımcılar:Dr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
Diğer Faaliyetler
Habertürk canlı yayın
Kategori: Detaylı Medya Katılımı
Tarih: 2026-10-08
Katılımcılar: Prof. Dr. Muhsin KONUK
Ordu yeni Haber-Hurma
Kategori: Detaylı Medya Katılımı
Tarih: 2026-07-21
Katılımcılar: Prof. Dr. Muhsin KONUK
Gaziantep İlk Haber-Hurma
Kategori: Detaylı Medya Katılımı
Tarih: 2026-07-20
Katılımcılar: Prof. Dr. Muhsin KONUK
İlişkili Enstitü, Fakülte, Meslek Yüksekokulu
Üyeler
Prof.Dr. Muhsin KONUKRektör Danışmanı / MDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik (İngilizce)
Prof.Dr. Kaan YILANCIOĞLUMDBF / Adli Bilimler / Biyogüvenlik Yüksek Lisans Programı Anabilim Dalı Başkanı / Bağımlılık ve Adli Bilimler Enstitüsü Müdürü (Vekaleten)
Prof.Dr. Pınar ÖZMDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik (İngilizce) Bölümü Başkan Yardımcısı / Nörobilim Yüksek Lisans Programı
Dr. Öğr. Üyesi O. Murat ANLIMDBF / Endüstri Mühendisliği
Doç.Dr. Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞIMDBF / Bölüm Başkanı Yardımcısı - Kimya Mühendisliği / FBE Biyoinformatik Yüksek Lisans Anabilim Dalı Başkanı
Dr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANSHMYO / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi ve Aromatik Bitkiler - Program Başkanı
Dr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALSHMYO - Müdür / Tıbbi Laboratuvar Teknikleri Program Başkanı / Radyoterapi
Dr. Öğr. Üyesi Doğukan MUTLUMDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik (Türkçe) / Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoteknoloji Anabilim Dalı Başkanı / Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi (ÜSUZEM) Müdürü / Uzaktan Eğitim Koordinatörü
Dr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAYSHMYO / Laboratuvar Teknolojisi - Program Başkanı
Dr. Öğr. Üyesi İmran GÖKERMDBF / Biyomühendislik
Dr. Öğr. Üyesi Salih TUNCAYSHMYO - Gıda Teknolojisi / Bilimsel Araştırma Projeleri (BAP) Koordinatörü
Dr. Öğr. Üyesi İrem Gülfem AKINMDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik (İngilizce) / PROMER / Müdür Yardımcısı
Sizi Arayalım
Paylaş
Güncelleme Tarihi: 30 Ekim 2020
Oluşturulma Tarihi: 27 Eylül 2019