Hesaplamalı Biyoloji ve In silico Çalışmaları Grubu, çeşitli biyoinformatik araçlar kullanarak hastalıklar (özellikle nörodejeneratif hastalıklar ve kanser) ile ilgili ve/veya önemli hücresel yolaklarda görev alan genlerin belirlenmesi, gen-gen etkileşimlerinin tespiti, genlerin ürünü olan proteinlerin yapısı ve fonksiyonu üzerine etkisi olabilecek polimorfizmlerin tahmin edilmesi ve proteinlerin yapısal olarak modellenmesi konusunda çalışmalar yapmaktadır.
Hesaplamalı Biyoloji ve In Silico Çalışmaları Grubu
Projeleri
Konjenital Laktoz İntoleransı İle İlişkili LCT Genine Ait Olası Zararlı Missense Tek Nükleotit Polimorfizmlerinin Analiz Edilmesi ve Hastalığa Karşı Yeni İlaç Aday Moleküllerinin In Silico Metotlar İle Geliştirilmesi
Kategori: TÜBİTAK
Başvuru No: 125Z687
Tarih: 2025-08-29
Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Sitotoksik Etkinliğinin Araştırılması
Kategori: BAP projesi
Başvuru No: 5169
Tarih: 2025-05-27
Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Karsinogenez Mekanizmaları Üzerine Etkisinin Araştırılması
Kategori: BAP projesi
Başvuru No: 5166
Tarih: 2025-05-27
Araştırma Odağı
Kitapları
- Handbook of Regenerative Medicine Stem Cell-based Approach
Kategori: Book Citation Index'de taranan yayınevi tarafından basılmış kitap bölümü yazarlığı
ISBN: E-ISBN 9781003464594
Tarih: 2025-01-01
Yazarlar:Prof. Dr. Muhsin KONUKDr. Öğr. Üyesi Öznur Özge Özcan
- SHMYO için Temel Biyokimya (Lipitler ve Biyomoleküller)
Kategori: ÜÜ yayinevi tarafından basılmış kitap bölümü yazarlığı
ISBN: 978-605-9596-81-7
Tarih: 2023-01-01
Yazarlar:Dr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANDr. Öğr. Üyesi Salih TUNCAYDr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAYDr. Öğr. Üyesi Öznur Özge Özcan
YayınlarıWOS Kapsamına Giren Yayınların Sayısı: 18Diğer Yayınların Sayısı: 9
- Molecular Docking, ADME, toxicity, and flexibility analysis of compounds in Withania somnifera L. for dopamine D2 receptor inhibition
Yayın Adı: Balıkesir Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
Tarih: 2025-10-25
- In Silico Analysis of Structural and Functional Impacts of Missense SNPs of SNCA Gene in Parkinson’s Disease
Yayın Adı: Kafkas Journal of Medical Sciences
DOI: 10.5505/kjms.2025.24307
Tarih: 2025-10-20
- Discovering Queuine from shape to property: insights from DFT calculations and MD simulations
Yayın Adı: Molecular Simulation
DOI: 10.1080/08927022.2025.2576150
Tarih: 2025-10-10
Kongre-Konferans Katılımları
ALZHEİMER HASTALIĞINDA ROLÜ OLAN BETA SEKRETAZ GENİNİN (BACE1) IN SILICO ANALİZİ
Kongre Adı: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Tarih: 2019-10-30
Katılımcılar:Prof. Dr. Muhsin KONUKDr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANProf. Dr. Korkut ULUCANDr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
BİLGİSAYAR TABANLI YAZILIM ARAÇLARI İLE APH1B GENİNDEKİ FONKSİYONEL SNP’LERİN TAHMİN EDİLMESİ
Kongre Adı: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Tarih: 2018-10-29
Katılımcılar:Prof. Dr. Muhsin KONUKDr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANProf. Dr. Korkut ULUCANDr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
In silico analizler ile insan BAK1 genindeki fonksiyonel SNP’lerin tanımlanması
Kongre Adı: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Tarih: 2018-05-03
Katılımcılar:Dr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
Diğer Faaliyetler
In Slico Laboratuvar kullanımı Eğitim Semineri 2 (SHMYO ve Mühendislik ve Doğa Bilimlerinden katılımcı akademisyen ve yüksek lisans öğrencilerine yönelik Eğitim)
Kategori: Fakülte - Bölüm veya SHMYO - Program semineri verme
Tarih: 2025-09-23
Katılımcılar: Dr. Öğr. Üyesi NİGAR ÇARŞIBAŞI
In Slico Laboratuvar kullanımı Eğitim Semineri 1 (SHMYO ve Mühendislik ve Doğa Bilimlerinden katılımcı akademisyen ve yüksek lisans öğrencilerine yönelik Eğitim)
Kategori: Fakülte - Bölüm veya SHMYO - Program semineri verme
Tarih: 2025-09-16
Katılımcılar: Dr. Öğr. Üyesi NİGAR ÇARŞIBAŞI
TEKNOFEST yarışması (P4MEDI ekibi )
Kategori: Yarışmalara katılan öğrenci projelerinde danışmanlık
Tarih: 2025-03-20
Katılımcılar: Prof. Dr. Muhsin KONUK
İlgili Enstitü, Fakülte, Meslek Yüksekokulu
Üyeler
- Prof.Dr. Muhsin KONUK
Rektör Danışmanı / MDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik (İngilizce) / Moleküler Biyoloji Yüksek Lisans Programı Anabilim Dalı Başkanı
Dr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAYSHMYO / Laboratuvar Teknolojisi - Program Başkanı
Dr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANSHMYO / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi ve Aromatik Bitkiler - Program Başkanı
Dr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALSHMYO - Müdür V. / Tıbbi Laboratuvar Teknikleri Program Başkanı / Radyoterapi / ÜSUZEM Müdür Yardımcısı
Dr. Öğr. Üyesi Salih TUNCAYSHMYO - Gıda Teknolojisi / Bilimsel Araştırma Projeleri (BAP) Koordinatörü
- Arş.Gör.Dr. İrem Gülfem AKIN
MDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik (İngilizce)

