Группа вычислительной биологии и in silico исследований занимается определением генов, связанных с заболеваниями (особенно нейродегенеративными заболеваниями и раком) и/или участвующих в важных клеточных путях, с использованием различных биоинформатических инструментов, выявлением ген-генных взаимодействий, прогнозированием полиморфизмов, которые могут оказывать влияние на структуру и функцию белков, являющихся продуктами генов, а также структурным моделированием белков.
Группа исследований по вычислительной биологии и In-Silico
Содержание
Направление исследований
ЗаседанияПоследние 5 заседаний
Bi̇yoki̇myasal Hesaplamalar Çalışma Grubu'nun 25092025 tarihli toplantısında “Üsküdar Üniversitesi in silico Araştırmalar Laboratuvarı (ÜSİNSİLİCOLAB)”ın kullanımı ve yürütülebilecek bilgisayar destekli uygulamalar hakkında görüşülmüştür.
Проекты
Aronia melanocarpa (Siyah Aronya) Meyvesinin Farklı Fraksiyonlarından Elde Edilen Ekstrelerin Antioksidan Kapasitelerinin ve LC-MS/MS ile Fenolik Bileşen Profilinin Belirlenmesi”
Категория: TÜBİTAK
Номер заявки: 1139B412502985
Дата: 2026-06-30
Aronia melanocarpa (Siyah Aronya) Meyvesinin Farklı Fraksiyonlarından Elde Edilen Ekstrelerin Antioksidan Kapasitelerinin ve LC-MS/MS ile Fenolik Bileşen Profilinin Belirlenmesi
Категория: TÜBİTAK Öğrenci Projesi
Номер заявки: 1139B412502985
Дата: 2026-05-15
Uyutan İplik (Sleeping Yarn)
Категория: TÜBİTAK
Номер заявки: 5250102
Дата: 2025-12-12
ПубликацииПубликации, индексируемые в Scopus: 41Количество других публикаций: 18
- Short and efficient synthesis of the natural triterpenoids α- and β-amyrins with detailed in silico screening and in vitro anticancer evaluation against breast and prostate cancer cells
Название публикации: Computational Biology and Chemistry
DOI: 10.1016/j.compbiolchem.2026.109333
Дата: 2026-12-01
Авторы:Dr. Öğr. Üyesi Salih TUNCAY
- Antioxidant capacity and α-glucosidase inhibitor activity of Bryonia aspera extracts and its major constituent p-coumaric acid: Phytochemical analysis, biological evaluation and computational approach
Название публикации: Journal of Molecular Structure
DOI: 10.1016/j.molstruc.2026.146580
Дата: 2026-10-01
Авторы:Dr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Salih TUNCAYÖğr. Gör. Dr. İsra TOPTANCI
- Sustainable bilge water treatment and bioelectricity generation in microbial fuel cells: impact of substrate complexity on microbial adaptation
Название публикации: Biodegradation
DOI: 10.1007/s10532-026-10374-y
Дата: 2026-09-07
Авторы:Prof. Dr. Tunç ÇATAL
Книги
- Bioactive Peptides Produced From Microbial Sources and Their Neuroprotective Effects: Microbial Peptides
Категория: Scopus/BKCI'de taranan yayınevi tarafından basılmış kitap yazarlığı
ISBN: ISBN13: 9798337341392, Isbn13Softcover: 9798337341408, EISBN13: 9798337341415
Дата: 2026-01-01
Авторы:Prof. Dr. Muhsin KONUK
- Handbook of Regenerative Medicine Stem Cell-based Approach
Категория: Scopus/BKCI'de taranan yayınevi tarafından basılmış kitap bölümü yazarlığı
ISBN: E-ISBN 9781003464594
Дата: 2025-01-01
Авторы:Prof. Dr. Muhsin KONUKDoç. Dr. Öznur Özge ÖZCAN
- Role of Stem Cell-Based Therapy in Neurodegenerative, Ocular, and Cardiovascular Diseases
Категория: Scopus/BKCI'de taranan yayınevi tarafından basılmış kitap bölümü yazarlığı
ISBN: 9781003464594
Дата: 2025-01-01
Авторы:Doç. Dr. Öznur Özge ÖZCAN
Участие в конференциях
ALZHEİMER HASTALIĞINDA ROLÜ OLAN BETA SEKRETAZ GENİNİN (BACE1) IN SILICO ANALİZİ
Название конференции: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Дата: 2019-10-30
Участники:Prof. Dr. Muhsin KONUKDr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANProf. Dr. Korkut ULUCANDr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
BİLGİSAYAR TABANLI YAZILIM ARAÇLARI İLE APH1B GENİNDEKİ FONKSİYONEL SNP’LERİN TAHMİN EDİLMESİ
Название конференции: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Дата: 2018-10-29
Участники:Prof. Dr. Muhsin KONUKDr. Öğr. Üyesi Ömer Faruk KARASAKALDr. Öğr. Üyesi Tuğba KAMANProf. Dr. Korkut ULUCANDr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
In silico analizler ile insan BAK1 genindeki fonksiyonel SNP’lerin tanımlanması
Название конференции: Ulusal kongre ve sempozyumlarda sözlü veya poster olarak sunulan ve yayımlanan tebliğ
Дата: 2018-05-03
Участники:Dr. Öğr. Üyesi Ebru ÖZKAN OKTAY
Другая деятельность
Sputnik radyo
Категория: Detaylı Medya Katılımı
Дата: 2026-11-03
Участники: Prof. Dr. Muhsin KONUK
Habertürk canlı yayın
Категория: Detaylı Medya Katılımı
Дата: 2026-10-08
Участники: Prof. Dr. Muhsin KONUK
Ordu yeni Haber-Hurma
Категория: Detaylı Medya Katılımı
Дата: 2026-07-21
Участники: Prof. Dr. Muhsin KONUK
Связано с Enstitü, Fakülte, Meslek Yüksekokulu
Участники
- Prof. Muhsin KONUK
Советник ректора / ФБMЕ / Молекулярная биология и генетика (на английском языке)
Prof. Kaan YILANCIOĞLUFMBF / Судебные науки / Заведующий кафедрой Магистерской программы по биобезопасности / Директор Института зависимости и судебных наук (и.о.)
Prof. Pınar ÖZFMBF / Заместитель заведующего кафедрой молекулярной биологии и генетики (на английском языке) / Магистерская программа по нейронаукам
Asst. Prof. O. Murat ANLIFENS / Промышленная инженерия
- Assoc. Prof. Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI
FMF / Заместитель заведующего кафедрой - Химическая инженерия / Заведующая выпускной программой магистратуры по биоинформатике Естественно-научного института
Asst. Prof. Tuğba KAMANШМХО / Институт медицинских наук / Медицинские и ароматические растения - Заведующая программой
Asst. Prof. Ömer Faruk KARASAKALСШМВУ / Директор / Заведующий программой «Техники медицинской лаборатории»
Asst. Prof. Doğukan MUTLUФМИ / Молекулярная биология и генетика (на турецком) / Заведующий кафедрой биотехнологии Института естественных наук / Директор Центра практики и исследований дистанционного образования (ÜSUZEM) / Координатор дистанционного образования
Asst. Prof. Ebru ÖZKAN OKTAYСВШМ / Лабораторная технология - Заведующая программой
Asst. Prof. İmran GÖKERFMBF / Биоинженерия
Asst. Prof. Salih TUNCAYСВМЮ / Пищевые технологии / Координатор проектов научных исследований (BAP)
- Asst. Prof. İrem Gülfem AKIN
FENS / Молекулярная биология и генетика (на английском языке) / PROMER / Заместитель директора

