Перейти к содержанию

Содержание

Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI, Ph.D

Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI, Ph.D

ORCID0000-0003-1013-6668

Assoc. Prof.

FMF / Заместитель заведующего кафедрой - Химическая инженерия / Заведующая выпускной программой магистратуры по биоинформатике Естественно-научного института

Публикации по областям (Scopus)

Biochemistry, Genetics and Molecular Biology: 88Chemistry: 66Chemical Engineering: 55Computer Science: 44Immunology and Microbiology: 33Materials Science: 33Biochemistry,GeneticsandMolecularBiologyChemistryChemicalEngineeringComputerScienceImmunologyandMicrobiologyMaterialsScience
Оцените нас

Академические ссылки

Scopus
Documents:19
Citations:1193
h-index:7
Google Scholar
Citations:1739
h-index:7
i10-index:7

52

Web of ScienceResearchgateYÖKPublons

Области исследований

Computer-aided drug design
Bioinformatics
Protein engineering
Protein-protein and protein-drug interactions
Protein modeling
Polymer Technology and Engineering.

Краткая биография

Doçent Doktor Nigar KANTARCI ÇARŞIBAŞI ; Родившаяся в 1979 году в Стамбуле, д-р Нигар Кантарджи Чаршибаши завершила свое среднее образование в Еюбоглукской естественнонаучной школе (Eyüboğlu Fen Lisesi) в 1994–1997 годах и окончила ее с отличием (первой по рейтингу). Свое бакалаврское образование она завершила в 2001 году на кафедре химической инженерии Босфорского университета. В 2001–2003 годах она продолжила обучение в магистратуре также на кафедре химической инженерии Босфорского университета и в этот период проводила исследования по гидродинамике и теплопередаче в разработанном и смонтированном ею «пузырьковом колонном реакторе». По результатам ее магистерской диссертации у д-ра Кантарджи Чаршибаши имеется 2 статьи, опубликованные в журналах, индексируемых в SCI. Проводившая в 2003–2009 годах докторские исследования в Центре полимерных исследований кафедры химической инженерии Босфорского университета, д-р Кантарджи Чаршибаши в рамках своей докторской диссертации работала над короткими белковыми цепями, связывающимися с металлами, с помощью молекулярно-динамического моделирования. В другом своем исследовании она проводила работы по моделированию белка p53, являющегося важным белком-супрессором опухолей, и взаимодействия этого белка с ДНК. В рамках же докторской диссертации, используя разработанную ею собственную технику математического моделирования, она смоделировала конформационные переходы белков и, объединив метод анизотропной сети с методом Монте-Карло, провела исследования путей перехода из открытого состояния в закрытое, из свободной формы в связанную для многих белков. В рамках докторских исследований д-ра Нигар Кантарджи Чаршибаши имеется 4 статьи, опубликованные в SCI. В настоящее время она продолжает свою работу на кафедре химико-биологической инженерии Факультета инженерии и естественных наук Университета Юскюдар. Владеющая английским языком на очень хорошем уровне и немецким на начальном уровне, д-р Кантарджи Чаршибаши имеет следующие академические интересы: биоинформатика, моделирование белков, белок-белковые взаимодействия, взаимосвязь «белок — структура — функция», компьютерный дизайн лекарств.

Образование и учёные звания

Бакалавриат

Boğaziçi Üniversitesi

2001

Магистратура

Boğaziçi Üniversitesi

2003

Научный сотрудник

Boğaziçi Üniversitesi

2003

Докторантура

Boğaziçi Üniversitesi

2009

Старший преподаватель

Üsküdar Üniversitesi

2019

Проекты > Проекты

Всего: 15

1

Uyutan İplik (Sleeping Yarn)
2028

2

Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Sitotoksik Etkinliğinin Araştırılması
2026

3

Ağız Kanserinde Apigenin/Vitexin Kombinasyonunun Karsinogenez Mekanizmaları Üzerine Etkisinin Araştırılması
2026

4

Nutrasötik Quein molekülü için etkinliğini artırmaya yönelik in siliko formülasyon geliştirilmesi ve optimizasyonu.
2026

5

Farklı LABSA ve SLES parametrelerine sahip deterjanların kemik dokudan DNA İzolasyonuna etkisinin araştırılması
2026

6

Farklı boyutlardaki çinko oksit (ZnO) nanoparçacıklarının güneş koruyucu etkisinin UVA/UVB parametre değerleri ile araştırılması
2026

7

Histamin H4 reseptörünün inhibisyonunu sağlayacak doğal kaynaklı potansiyel antihistaminik moleküllerin in siliko keşfi ve in vitro kimyasal validasyonu
2026

8

Insiliko yöntemler ile hedefe yönelik ilaç keşfi, tasarımı ve optimizasyonu
2027

9

Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları
2024

10

Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi
2025

11

Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi
2025

12

Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması
2023

13

Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması
2023

14

İn Silico Analiz ile Aday mglu2 Pozitif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi
2023

15

In Silico Analiz ile Aday mglu2 Positif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi
2023

Руководство диссертациями

Всего: 4

1

Nutrasötik moleküllerin pankreas kanserindeki etkinliklerinin in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması
2024

2

Investigation of the effect of temperature and electrolytic properties on heat transfer and conductivity in aqueous salt solutions
2024

3

Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması
2023

4

Kanser tedavisinde Murine Double Minute 2 proteininin inhibasyonu için ligand-bazlı farmakofor modelleme tekniği ile yeni moleküllerin tasarımı
2022

Академическая деятельность > Участие в конгрессах и конференциях

Всего: 11

1

DRUG REPOSITIONING FOR ALZHEIMER'S DISEASE AND GLIOBLASTOMA TREATMENT
2024

2

Investigation of the heat transfer characteristics and electrical conductivities of NaCl, KCl, and NaNO3 solutions
2024

3

Discovery and biological evaluation of potential Map4k4 inhibitors for the treatment of pancreatic cancer
2024

4

Queuine as a potential multi-target drug for Alzheimer’s Disease
2024

5

INVESTIGATION OF NOVEL NATURAL COMPOUNDS AGAINST ALZHEIMER’S DISEASE TARGETING ACETYLCHOLINESTERASE
2023

6

Proposing novel natural compounds against Alzheimer’s Disease targeting acetylcholinesterase
2023

7

TOWARDS MORE POTENT ANTICANCER DRUGS: PHARMACOPHORE MODEL ACCOMPANIED BY CONFORMATIONAL DYNAMICS REVEALS NEW P53 ACTIVATORS
2022

8

Pharmacophore Model Accompanied by Conformational Dynamics Reveals New Anti-cancer Drugs
2022

9

Identification of natural molecules for anticancer activity against MDM2 using conformational dynamics and molecular docking
2021

10

Elucidation of Dynamics of MDM2 Shed Light on the Anti-cancer Drug Development
2021

11

Global Dynamics of MDM2 and Alterations Caused by Inhibitor Binding: an Elastic Network Model Approach
2021

Административная деятельность

Всего: 9

1

Laboratuvar Sorumlusu
2025

2

100 -150 Öğrenci Danışmanlığı
2025

3

Biyoinformatik
2024

4

Kalite Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO)
2022

5

Erasmus Bölüm Koordinatörlüğü
2022

6

Kimya-Biyoloji Mühendisliği Kulübü
2022

7

Nörogenetik Çalışma Grubu
2022

8

Kimya-Biyoloji Mühendisliği (İngilizce) Bölüm Başkan Yardımcısı
2021

9

Eğitim Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO)
2019

Учебная и преподавательская деятельность

Всего: 9

1

Polymer Processing Principles, Applications and Modeling
LISANSUSTU / 2024

2

Graduation Thesis
LISANS / 2024

3

General Chemistry II
LISANS / 2024

4

Modelleme ve Simülasyon
LISANSUSTU / 2024

5

Drug Design
LISANSUSTU / 2024

6

Graduation Project
LISANS / 2024

7

Mass and Energy Balances
LISANS / 2024

8

General Chemistry I
LISANS / 2024

9

Stoichiometry
LISANS / 2024