Mehmet Yakup Tuna, 1975 yılında İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi’nden mezun olmuştur. Tıpta uzmanlık eğitimini Anatomi ve Genel Cerrahi alanında 1984 yılında tamamlayan Tuna, 1987 yılında Anatomi alanında Doçentliğini almış ve 1996 yılında Profesör unvanına sahip olmuştur.