Emre Karaduman, lisans eğitimini Yıldız Teknik Üniversitesi Kimya-Metalurji Fakültesi Metalurji ve Malzeme Mühendisliği Bölümü’nde tamamlamış olup, Yüksek lisans ve doktora eğitimini de yine Yıldız Teknik Üniversitesi'nde Biyomühendislik Anabilim Dalı'nda tamamlamıştır.