Dr.Öğr. Üyesi Cihan TAŞTAN

Araştırma Alanları İle Örtüşen BM Sürdürülebilir Kalkınma Hedef Etiketleri

Yönetilen Lisansüstü Tezleri

1. Investigation of Anti-Cancer Activities of CAR-T Cells Against Primary Glioblastoma Cells, 2024.
2. Investigation of CRISPR/Cas12a-Based Antivirals Targeting Wheat Dwarf Virus (WDV) for the Prevention of Wheat Infections, 2024.
3. In Vitro Investigation of Antisense Xeno Nucleic Acid (XNA-ASO) Approaches to Increase Inclusion of Exon7 in SMN2 (Survival Motor Neuron) Gene in parallel with stable CRISPR-Prime Editing Modification Approaches, 2024.
4. COMPARISON OF INTRON 7 TARGETED NEXT GENERATION ANTISENSE XENO NUCLEIC ACID (XNA-ASO) APPROACHES TO INCREASE SMN2 GENE EXPRESSION AND CELL VIABILITY IN SPINAL MUSCULAR ATROPHY (SMA) DISEASE IN SMA FIBROBLAST TYPE 2 AND SMN1 KNOCKOUT CELLS, 2024.
5. Synthetic Biology Approaches in the Treatment of Spinal MuscularAtrophy: In Vitro Investigation of the Effects of Combined Xeno-Nucleic Acid /DNA antisense oligonucleotides (XNA/DNA-ASO) on SMN2 gene expression and cell viability, 2024.
6. Fı̇tohemaglutı̇nı̇n ve anti-CD3&anti-CD28tabanlı CD19 spesifik car-t hücre üretimlerinin in vitro ve in vivo etkinliklerinin araştırılması, 2024.
7. Anti-CD3&anti-CD28 tabanlı iki farklı CD19 spesifik CAR(CD28)-t ve CAR(4-1BB)-t hücre üretiminin in vitro ve in vivo etkinliklerinin araştırılması, 2024.
8. In vitro generation and characterization of the Wu syndrome model that causes mental retardation in neural cell lines, 2024.
9. Investigation of the ın vitro and ex vivo efficacy of the CRISPR-PE system according to the types of Spinal Muscular Atrophy disease, 2024.
10. Crispr-prime editing yaklaşımının Spinal Musküler Atrofi in vitro modelinde off-target kapasitesinin, sitotoksisitesinin ve SMN protein ekspresyonunun stabilitesinin araştırılması, 2024.
11. CRISPR PRIME EDITING GEN DÜZENLEME YAKLAŞIMLARI KULLANILARAK SURVIVAL MOTOR NÖRON-2 (SMN2) GENİ ÜZERİNDEKİ NOKTA MUTASYONLARIN ONARIM ETKİNLİĞİNİN ARAŞTIRILMASI, 2023.
12. METİSİLİNE DİRENÇLİ KLİNİK STAPHYLOCOCCUS AUREUS İZOLATLARINDA ANTİBİYOTİK DİRENCİNİN CRISPR/Cas9 TEMELLİ GENOM DÜZENLEMESİ İLE BASKILANMASI, 2023.
13. KATI TÜMÖRLERDE YÜKSEK ANTİTÜMÖR ETKİNLİĞİ GÖSTERİLMİŞ MONOKLONAL ANTİKORLARLA YENİ NESİL KİMERİK ANTİJEN RESEPTÖR TASARLANMASINDA BİYOİNFORMATİKSEL YAKLAŞIMIN ARAŞTIRILMASI, 2022.

1. CAR-T Cell Therapy in Cancer: Current Pros and Cons, Cihan Taştan, Gamze Gülden, Berranur Sert, Türkiye Klinikleri, 2024
2. Adaptive Chromosome Diagnosis Based on Scaling Hierarchical Clusters., Muhammed Akif Ağca, Cihan Taştan, Kadir Üstün, Ibrahim Halil Giden, Springer, Cham., 2021

1. Apoptoz ve Otofaji İlişkili Mekanizmalarda CRISPR-Cas Uygulamaları -Hastalıkta ve Sağlıkta Hücre Ölümü - Mekanizmaları ve Deneysel Araştırma Modelleri, Ayşenur Kurt, Huriye Akın, Cihan Taştan, Hücre Ölümü Araştırma Derneği Yayınları, 2022
2. Pandemik Virüs Salgınlarında CRISPR Gen Mühendisliği İle Tanı, Araştırma Ve Tedavi Yaklaşımları, Cihan Taştan, IKSAD PUBLISHING HOUSE, 2020
3. Nadir Hastalıkların Tedavisinde Gen Terapisi, Cihan Taştan, Yasemin Kartal, Gamze Gülden, Mehmet Emin Köse, Nobel Akademik Yayıncılık, 2019
4. Yapay Zeka ve Genetik Mühendisliği, Cihan Taştan, Çağlayan Kitabevi, 2019

Akademik Faaliyetler > Editörlük

1. Gene Editing, ISBN:2687-640X, 2020.

Projeler > Projeler

1. Glikojen Depo Hastalığı (GSD) Tip 1a Hastalığının Tedavisi İçin 3B Yazıcı ile Kapsüle Edilmiş G6PC Transgenik Mezenkimal Kök Hücre ve Hepatosit Hücrelerinin Etkinliğinin In Vitro ve Ex Vivo Araştırılması, 2025.
2. Crispr-Cas9 Yöntemiyle ALYREF ve PIN1 Geni Knock-Out Edilen Hücrelerde ve SLE Hastalarından İzole Edilen Lökositlerde Transkriptom Analizi., 2025.
3. Ökaryotik Programlanabilir RNA Kılavuzlu Endonükleaz Olan Fanzor'la Tümör İlişkili p53, HSPA8 ve PD1 Genlerinin Primer İnsan T Hücre Hattında Silinerek Kanser Direncinin Araştırılması., 2025.
4. Moleküler Alman Tank Problemi Yaklaşımını Kullanarak Gizli Barkodlu Kanser Hücresi Sürüsünü Tahmin Etmek, 2025.
5. Fanzor Proteinine Benzerlik Oranı Yüksek Olan Anjiyotensin ve Bradikinin Reseptörlerinin Kodlayan Genlerin Crıspr-Cas ile Knock-Out Edilmesi ve Etkilerinin İncelenmesi, 2025.
6. İnsan DNA'sında bulunan CODIS tarafından kabul gören STR lokuslarının bir genom düzenleme ve editleme aracı olan CRISPR/Cas12a sisteminde tanınmasını ve motif tekrar sayısının tespitini yapmak, 2025.
7. SIRPa geni knock-out edilmiş kordon kanından türevli NK hücrelerinin primer küçük hücre dışı akciğer kanseri hücreleri üzerindeki sitotoksik etkisinin araştırılması, 2025.
8. Developing A Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) kit for detection of FecB gene variants in sheep blood.” "Koyun kanında FecB gen varyantlarının saptanması için Döngü Aracılı Izotermal Amplifikasyon (LAMP) kitinin gelistirilmesi., 2024.
9. Otoimmün Hepatit (AIH)’te C4A Geni Delesyonuna Sahip Hastaların Hepatosit Hücrelerinde C4A Geni Protein Seviyesi Arttırılması, 2024.
10. Nöroblastom Hücre Hattı SH-SY5Y ve Insan Oligodendroglial Hücre Hattı (HOG) Co-Kültüründe Cuprizone-Indüklenmis In Vitro Multipl Skleroz (MS) Modelinin Olusturulması ve Lentiral MOG Transdüksiyonu Sonrası Remiyelinizasyonun Arastırılması, 2024.
11. Glikojen Depo Hastalığı (GSD) Tip 1a Hastalığının Tedavisi İçin 3B Yazıcı ile Kapsüle Edilmiş G6PC Transgenik Mezenkimal Kök Hücre ve Hepatosit Hücrelerinin Etkinliğinin In Vitro ve Ex Vivo Araştırılması, 2024.
12. Topoizomeraz IIbeta Aşırı İfade Eden İnsan Kordon Mezenkimal Kök Hücre Kaynaklı Eksozomların 5XFAD Transgenik Alzheimer Hastalığı Fare Modelinde Tedavi Etkinliğinin Araştırılması, 2026.
13. Üsküdar Üniversitesi ve Aster Tekstil Üniversite Sanayii İşbirliği Projesi, 2025.
14. Genotypical Analysis Project on personalized treatment for psychosis and for dependence on alcohol and other psychotropic substances., 2025.
15. MESAJ BİLİM MİSYONU (MİKRO YER ÇEKİMİ İLİŞKİLİ BİLİM GRUBU), 2024.
16. Nöral Farklılaştırılmış ve Amiloid β1-42 Peptitleriyle in vitro Alzheimer Hastalığı Modeli Oluşturulmuş SHSY5Y Hücrelerinde Kararlı DNA Topoisomerase IIb Aşırı İfadesinin Nöroprotektif Rolünün Araştırılması, 2024.
17. Nöral Farklılaştırılmış ve Amiloid β1-42 Peptitleriyle in vitro Alzheimer Hastalığı Modeli Oluşturulmuş SHSY5Y Hücrelerinde Kararlı DNA Topoisomerase IIb Aşırı İfadesinin Nöroprotektif Rolünün Araştırılması, 2024.
18. Ailevi Akdeniz Atesi Hastalıgı Iliskili Mutant MEFV Geninde CRISPRPrime Editing Yöntemi ile M680I c.2040G>C Mutasyonunun Düzenlenmesinin Ex-Vivo Arastırılması, 2024.
19. Axolotl Canlılarında Deselerizasyon Sonucu Insan Nöron Hücrelelerinin Ko-Kültürü ve Repopülasyonu, 2023.
20. Yüksek BCL-2 ve USP7 Gen Ifadesine Sahip Küçük Hücreli Olmayan Akciger Kanserlerinde Yeni Nesil XNA ve DNA Antisens Oligonükleotit (ASO) Yaklasımlarının Incelenmesi, 2023.
21. Ailevi Akdeniz Atesi Hastalarından Izole Periferik Kan Mononükleer Hücrelerde M694V c.2080A>G Mutasyonunun CRISPR-Prime Editing Yöntemi ile Gen Düzenlenmesinin In-vitro ve Ex-Vivo Arastırılması, 2023.
22. Yer çekimsiz Ortam Kosulları Saglayan Akustik Havaya Yükseltme (Levitasyon) Cihazında Mezenkimal Kök Hücrelerinin Proliferasyonunun ve Diferansiyasyonun Arastırılması (In vitro), 2023.
23. IL-21 gen ifadelesi arttırılmış NK-92 hücre hattı kaynaklı eksozomların NK hücre aktivasyonu ve tümör öldürme kapasitelerinin araştırılması., 2023.
24. Doğal Öldürücü Hücre Aktivasyon Gen İfadeleri Arttırılmış Nk-92 Hücre Hattı Kaynaklı Eksozomların, Küçük Hücreli Olmayan Akciğer Karsinom Hastaları Primer Tümör Hücreleri Ve Primer Nk Hücreleri Üzerindeki Etkisinin Araştırılması, 2025.
25. CRISPR Prime Editing Gen Düzenleme Teknolojisi Ile Survival Motor Protein 2 (SMN2) Geni Hedefli Tek Nokta Nükleotit Modifikasyon Etkinliginin, Stabilitesinin ve Hedef-Dısı Mutasyon (Off-Target) Kapasitesinin In Vitro ve Ex Vivo Arastırılması, 2023.
26. IL-21 gen ifadelesi arttırılmış NK-92 hücre hattı kaynaklı eksozomların NK hücre aktivasyonu ve tümör öldürme kapasitelerinin araştırılması., 2023.
27. Spinal Musküler Atrofi (SMA) Hastalığında SMN2 Gen Düzenlemesine Yönelik Ekzon7/ İntron 7 Hedefli Yeni Nesil CRISPR-Prime Editing ve SMN1 Kodlayan Motor Nöron Hücre Spesifik Nöral Lentivirüs Yaklaşımlarının İn Vitro ve Ex Vivo Araştırılması, 2024.
28. Spinal Musküler Atrofi (SMA) Hastalığında SMN2 Gen Katılımını Artırmaya Yönelik İntron 7 Hedefli Yeni Nesil Antisense Xeno Nükleik Asit Yaklaşımlarının İn Vitro ve Ex Vivo Araştırılması, 2023.
29. Yer Çekimsiz (Mikrogravity)Ortam koşulları Sağlayan Akustik Levitasyon Cihazının Geliştirilmesi Ve Temel Biyolojik Deneyler İle İn vitro Etkinliğinin Araştırılması, 2023.
30. cpn60 ve cpn10 Saperon Gen Kasetinin Gluconacetobacter xylinus?a Aktarımı Ile Rekombinant, Soguga Dayanıklı Gluconacetobacter xylinus Sus Olusturulması ve Sogukta Selüloz Stabilitesinin In Vitro Arastırılması, 2023.
31. Gluconacetobacter xylinus Bakterisinde Selüloz Üretim Verimliligini Artırmak Için AcsA, AcsB, AcsC, AcsD genlerinde CRISPR cas9 Indel Mutasyonlarının Olusturulması ve Verimlilik Etkinliginin In-vitro Arastırılması, 2023.
32. Fibroblast Hücrelerde Epidermolizis Bülloza Hastalıgına Yönelik Xeno Nükleik Asit ASO Tedavi Stratejisi, 2023.
33. Ilaç alerjisine sahip hastalarda immün profilleme ve genetik analize dayalı soy agacı arastırması, 2023.
34. Ailevi Akdeniz Atesi hastalarından izole T hücrelerinde CRISPR- dCas9- Vp64 hedefli IL1RN gen aktivasyonu iliskili sitokin salınım profilinin in vitro ve ex vivo arastırılması, 2023.
35. Mezenkimal kök hücrelerin lentivirüs aracılı nörotrofik faktör genlerinin aktarılması ile koklear tüy hücresi benzeri hücrelere farklılastırılmasının in-vitro arastırılması, 2023.
36. Flavonifractor plautii Bakterisinin FpGalNAcDeAc ve FpGalNase Enzimlerinin Rekombinant Olarak E.coli?de Üretiminin Saglanması ve Insan A Kan Gurubunu Evrensel 0 Kan Grubuna Çevrilmesinin in vitro Arastırılması, 2023.
37. Transgenik Mezankimal Kök Hücre Uygulamalarında 3D Yazıcı ile Gelistirilecek Kapsülasyon Yöntemleri Etkinliginin In Vitro Arastırılması, 2023.
38. Yer Çekimsiz Ortam Kosulları Saglayan Akustik Havaya Yükseltme (Levitasyon) Cihazında Kanser Hücrelerinin Proliferasyonunun ve Sag kalımının Arastırılması (In vitro), 2023.
39. Azot Emilimini Arttırmaya Yönelik CRISPR Cas9 Sistemiyle Nitrata Duyarlı (HNS) Gen Ailesinin Üzerinde CRISPR Cas9 Hedefli Mutasyon Taraması Yapmak ve Biyoyakıt Verimliligine Olan Etkisinin In Vitro Arastırılması, 2023.
40. Chlamydomonas reinhardtii?de CRISPR-Cas9 Gen Düzenleme Yöntemi ile Fosfolipaz A2, CpFTSY ve ZEP Genlerinde Genetik Mutasyon Analizleri Olusturulması, Fotosentetik Aktivitesindeki ve Lipit Aktivitesindeki Etkinliginin in vitro Arastırılması, 2023.
41. Mezenkimal Kök Hücrelerde Epidermolizis Bülloza Hastalıgına Yönelik DNA ASO Tedavi Stratejisi, 2023.
42. Cüce Cavendish'de Muz Çizgi Virüsüne karşı CRISPR/Cas9 uygulamaları ile muz bitkisinin etkinliğini ve direncini artırmaya yönelik araştırma, 2022.
43. İlaç İçeriklerinin Bozulmasının Pratik Takibi Üzerine DNA Mürekkebi Geliştirilmesi ve Ürünün Orijinalliğinin Tespiti İçin DNA Barkotlama Teknolojisinin Geliştirilmesi, 2022.
44. Aksolotllarda kanser direnç geni olan p53 geninin lentivirüs aktarım metodu ile insan hücre hatlarında entegrasyonu ve anti-tümör etki çalışılması., 2022.
45. Kansere Özgün Değiştirilebilir Başlıklı Adaptör CAR-T Hücre Geliştirilmesi ve Anti Kanser Etkiniğinin Değerlendirilmesi, 2022.
46. TCR Blokajı ile Evrensel, Satışa Hazır CAR-T Hücresi Üretimi ve Anti-Kanser Etkinliğinin Değerlendirilmesi, 2022.
47. Primer Glioblastoma Hücrelerinde HER2 ve GD2 Hedefli Tandem CAR-T Hücrelerinin Etkinliğinin Değerlendirilmesi, 2022.
48. CRISPR.bot: Robotik Otonom Sistemler ile Bakterilerde Genetik Mühendislik, 2022.
49. Buğdayın (Triticum vulgare), buğday cüce virüsü (WDV)’ne karşı direncini artırmak için CRISPR tabanlı modifikasyonların uygulanması, 2022.
50. HIV HIZLI TANI KİTİ, 2021.
51. Antibiyotik Dirençli Mycobacterium Smegmatis Bakterisi için CRISPR Kullanarak Dirençsiz Hale Getirmek, 2021.
52. Antibiyotiğe Dirençli Escherichia Coli Bakterisini CRISPR ile Dirençsiz Hale Getirme, 2021.
53. Milnesium tardigradum türünde bulunan hsp70 proteini ile Rekombinant Dondurma Solüsyonu, 2022.
54. Phytohemagglutinin/ aCD3&aCD28 Tabanlı İki Farklı CD19 Spesifik CAR (CD28/4-1BB) T Hücre Üretiminin Pre-Klinik In Vitro ve In Vivo Etkinliklerinin Karşılaştırılması, 2023.
55. Üsküdar Üniversitesi, Hücresel Tedavi ve Kök Hücre Üretim, Uygulama ve Araştırma Merkezi (ÜSKÖKMER) Bünyesinde Kök Hücre ARGE Laboratuvarı ve TRGENMER (Transgenik Hücre Teknolojileri ve Epigenetik Uygulama ve Araştırma Merkezi) Bünyesinde Transgenik Hücre, 2021.

Akademik Faaliyetler > Kongre - Konferans Katılım

1. 75th International Astronautical Congress, 2024.
2. 3. Tüp Bebek ve İnfertilite Derneği Kongresi, 2024.
3. 10. Karadeniz Hematoloji Kongresi, 2024.
4. 9. Uluslararası Erciyes Tıp Tıbbi Genetik Kongresi, 2024.
5. 21st Annual World Congress of SBMT (Brain, Spine and Mental Health), 2024.
6. The 4th Scientific International Congress on SMA in Ghent 2024, 2024.
7. 16. Ulusal Kemik İliği Transplantasyonu ve Hücresel Tedaviler Kongresi, 2024.
8. BioTürkiye Uluslararası Biyoteknoloji Kongresi, 2023.
9. 6th Basic and Clinical Multimodal Imaging Conference, 2023.
10. İYTE 4. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Genetik Öğrenci Kongresi, 2023.
11. 3rd International & 5th National CRISPR Symposium, 2023.
12. Yeditepe Üniversitesi 10. Ulusal Genetik ve Biyomühendislik Kongresi, 2023.
13. 2022 ECNS Conferences - EEG and Clinical Neuroscience Society, 2022.
14. 6th INTERNATIONAL CONFERENCE ON ADVANCES IN NATURAL AND APPLIED SCIENCES, 2022.
15. 11. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi, 2022.
16. I. International Advances in Molecular Biology Congress, 2022.
17. 44th COSPAR Scientific Assembly, 2022.
18. MIDDLE EAST (ME) + Brain Initiative, 2022.
19. 11th European Conference on Rare Diseases & Orphan Products, 2022.
20. 11th European Conference on Rare Diseases & Orphan Products, 2022.
21. 1. Ulusal Tıp Öğrencileri Kongresi, 2022.
22. SBÜBAK 1. ULUSAL ÖĞRENCİ KONGRESİ, 2022.
23. Pharmainovatif Hit2022 Kongre, 2022.
24. 6. Farmasötik Gelişim Günleri, 2022.
25. SBMT 19th Annual Congress, 2022.
26. 3rd International Eurasian Conference on Science, Engineering and Technology (EurasianSciEnTech 2021), 2021.
27. Çocuk Göğüs Hastalıkları 5. Kongresi, 2021.
28. XVII. Tıbbi Biyoloji ve Gene@k Kongresi, 2021.
29. Eskişehir 2. Sağlık ve Bilişim Sempozyumu, 2021.
30. Yıldız Teknik Üniversitesi Medikal Teknolojiler Kulübü Medivation II Zirvesi, 2021.
31. IEEE GTU G.E.N.4, 2021.
32. HIT2021 Kongresi, 2021.
33. European/International online meeting for the COST iPLANTA action : The Contribution of RNAi to Sustainable and Resilient Food Systems & Health, 2021.
34. IEEE YTÜ EMBS BİOFORM VIII, 2020.
35. 8. Ulusal Biyomühendislik Öğrenci Kongresi, 2020.

İdari Faaliyetler

1. Kurul Üyeliği / Board Member, FİHADEK, (2024 - Devam ediyor.)
2. Komisyon Üyesi / Member of Commission, Strateji Geliştirme Koordinatörlüğü Komisyonu, (2024 - Devam ediyor.)
3. Merkez Müdürü / Head of Resarch Center, TRGENMER, (2021 - Devam ediyor.)
4. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership, Nörogörüntüleme Çalışma Grubu, (2021 - Devam ediyor.)
5. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership, NPNörogenetik Çalışma Grubu, (2021 - Devam ediyor.)

Ödüller

1. En İyi Sözlü Bildirim Ödülü (V. Uluslararası Katılımlı Deneysel Hematoloji Kongresi), (Deneysel Hematoloji Derneği), 2018.
2. Ord. Prof. Dr. Süreyya Tahsin Aygün Araştırma Ödülü (3. Kök Hücre ve Hücresel Tedaviler Kongresi), (Kök Hücre ve Hücresel Tedaviler Derneği), 2019.
3. Dijital Verilerin DNA'da Depolanmasına Yönelik HiDNA Girişimi, (Sanofi-Pharmup Programı), 2019.
4. Türkiye Geneli Nadir Hastalıklar Genetik Tedavi Yarışması - HiDNA-RaDiChal ile Yılın Medikal Endüstri Ödülleri- Yılın Sosyal Sorumluluk Projesi ödülü, (Doktorclub Awards), 2020.
5. The Experimental Biology and Medicine (EBM) Outstanding Reviewer Award, (The Society of Experimental Biology (SEBM)), 2021.
6. “Limitless Makers” (Sınır Tanımayan Çözümler) Programına sunduğu katkılarından ötürü Limitsizlik Nişanı, (Gençlik ve Spor Bakanlığı), 2022.
7. Deneysel Hematoloji dalında Bildiri Ödülü, (Türk Hematoloji Derneği), 2022.
8. Sözlü Bildiri 3.lük Ödülü, (BIO Türkiye International Biotechnology Congress), 2023.
9. Genç Bilim İnsanı Ödülü, (Üsküdar Üniversitesi Genç Bilim İnsanı Ödülü), 2023.

Bilimsel Üyelikler

1. Başkan Yard., EKSTRASELLÜLER VEZİKÜLLER DERNEĞİ 2024
2. Aktif Üye (AACR ID: 1259544), American Association for Cancer Research 2023
3. (Genel Sekreter), Tedavisel Beyin Haritalama, Biyolojik Psikiyatri ve Nöroteknoloji Derneği 2022
4. The Society of Experimental Biology (SEBM) 2021
5. Aktif Üye, MOLEKÜLER BİYOLOJİ DERNEĞİ 2018

Eğitim ve Öğretim Faaliyetleri